高通量细胞筛选技术 (high 2 throughput cell - based screening technology) 是以高通量方式研究基因功能最有效的方法之一。通常 , 基因功能的初步筛选在 96 孔或 384 孔板上进行 , 通过基因转染将候选基因导入细胞 , 或直接将基因表达产物加入细胞培养液中。筛选测定方法基于要研究的生物学或医学问题 , 例如 , 要研究抗血管生成活性 , 选用内皮细胞进行细胞生长、分化、迁移和粘附等分析测定 ; 研究免疫调节活性 , 可选择淋巴细胞或造血细胞进行细胞生长和分化的分析测定 ; 研究神经营养因子活性 , 可选用神经细胞进行细胞存活、突起生长测定。除上述与细胞表型或形态学相关的检测指标外 , 细胞信号转导通路、糖代谢、能量产生和代谢产物分析 (metabolic control analysis) 等代谢通路也是基因功能重要的研究内容。

　　结合抗体芯片技术、多路测定技术 (multiplexing) 等新的检测方法 [12 ～ 14 ] , 高通量细胞筛选的应用更为广泛。另外 , 随着荧光成像读板仪 (fluorescence image plate reader ,FLIPR) 、定量 PCR 、高通量荧光激活细胞分类器 (HT 2 FACS) 等检测方法和技术的不断发展和应用 , 灵敏度和重现性这两个高通量细胞筛选的关键问题也逐步得以解决。

初筛得到的基因通常选用二级分析模型进行功能验证 , 验证方法可能通量略低 , 但与功能的相关性更强。