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数字PCR在临床和预后融合基因检测的应用

2020.2.05

众所周知，融合基因检测对临床诊断及预后指导都具有十分重要的意义。那么究竟什么是融合基因呢？

融合基因的发现始于上个世纪60年代，它是指染色体断裂后又重新拼接。如果恰巧拼接时发生了错误，使两个不同基因互相融合，大多数情况下，它会造成某些序列或功能异常的蛋白表达，亦或者是某些基因表达失调，从而促进肿瘤的发生。

传统的数字PCR检测融合基因的方法主要有显微观察，原位杂交等；新一点的方法有高通量测序等，但多因为发生基因融合原因的多样性，融合基因的表达量较低等因素而达不到精确的测定。

目前，新的定量技术-数字PCR方法的发展使得精确检测融合基因变成了可能。如一篇文章中报道所示

毛细胞星形细胞瘤（Pilocytic astrocytomas）是年轻患者中最常见的神经胶质瘤亚型，占所有神经胶质瘤的5.4％。KIAA1549基因和BRAF基因融合是毛细胞星形细胞瘤的标志，能够精确检测到二者的融合对于诊断至关重要。此外，由于KIAA1549-BRAF融合性地激活MAP激酶途径，因此它也代表了诸如MEK抑制剂之类的药物的靶标。研究人员用数字PCR的方式检测了一批福尔马林固定石蜡包埋组织上的KIAA1549-BRAF基因融合情况，包括40个毛细血管星形细胞瘤，27个难以分类的神经上皮肿瘤，15个胚胎发育不良的神经上皮瘤和18个神经胶质瘤。并将该结果和检测KIAA1549-BRAF融合状态的金标准技术RNA测序方法进行比较，结果发现与RNA测序相比，数字PCR检测的灵敏度和特异性为100％。

到目前为止，人们已经发现了大约2万个融合基因，但是它们在癌症发展中相关机制仍知之甚少。因此，能够精准的检测出融合基因并对其进行相关研究，是癌症精准医疗中的重要一步。目前采用数字PCR进行融合基因的检测正逐渐变成一种主流方法。

微滴芯片数字PCR系统，利用cutting-edge微流体创新型芯片——Sapphire芯片作为数字PCR过程的唯一耗材。样品通过毛细通道网格以30,000个微滴的形式进入2D芯片中。并且还是首款3色荧光检测仪器，整个流程只需要两个半小时。结合强大的图像分析技术和直观可视的检测功能，从而达到了数字PCR定量卓越的置信水平，获得的数据真实可信。