通用型植物线粒体DNA萃取试剂盒使用说明(二)
植物细胞或原生质体线粒体DNA分离(物理法)
实验开始前,将试剂盒里的净化液(Reagent C)冻融,然后移出1毫升净化液(Reagent C)和4毫升的裂解液(Reagent B)到15毫升锥形离心管里,混匀后,标记为裂解工作液,置入冰槽里备用。然后进行下列操作。
准备5 X 107植物细胞或原生质体
移入一个50毫升锥形离心管
放入台式离心机离心10分钟,速度为200g
小心抽去上清液
加入5毫升预冷的清理液(Reagent A),混匀细胞
放入台式离心机离心10分钟,速度为300g
小心抽去上清液
加入预冷的5毫升裂解工作液
涡旋震荡5秒,充分混匀细胞颗粒群
即刻放入预冷的DOUNCE匀浆器,在冰槽里用匀浆棒匀化细胞(约80下)(注意:参见注意事项7)
将所有细胞匀浆物移入15毫升锥形离心管,放入4℃台式离心机离心10分钟,速度为1500g
小心移出上清液(注意:不要触碰沉淀物)到另一个新的预冷的15毫升锥形离心管(如果上清液含有肉眼可见的残渣,重复离心5分钟一次,速度为3000g)——此步骤去除细胞壁、淀粉颗粒、细胞核和未溶解的细胞以及完整质体等残渣
放入4℃超速离心机离心10分钟,速度为10000g
小心抽去上清液,保留沉淀颗粒——此步骤获得线粒体沉淀物(注意:如果暂时停止操作,须暂时放进-70℃冰箱里)
加入300微升破膜液(Reagent F)到线粒体颗粒样品中
涡旋震荡15秒,混匀颗粒群
转入1.5毫升离心管
置入冰槽中孵育15分钟
加入30微升去干扰液(Reagent G)
用200微升枪头上下抽吸混匀
放进37℃恒温水槽孵育15分钟
加入30微升酶解液(Reagent H)
涡旋震荡15秒
放进58℃恒温水槽或干式培养仪孵育2小时
置于室温下冷却15分钟,直至处于室温状态(或置于冰槽里15至30秒)
加入300微升萃取液(Reagent I)(注意:使用前摇匀)
涡旋震荡5秒
放进微型台式离心机离心5分钟,速度为16000g(或13000RPM,例如eppendorf 5415)
移出上层液相溶液到新的1.5毫升离心管(注意:切莫触碰液相交界面上的白色膜状物)
加入100微升浓缩液(Reagent J)到新的离心管
加入1微升助沉液(Reagent K)
加入800微升沉淀液(Reagent L)
在涡旋震荡仪上震荡5秒,充分混匀
放进微型台式离心机离心15分钟,速度为16000g(或13000RPM,例如eppendorf 5415)(注意:离心前做好方位标记,以便离心后观察管底沉淀颗粒)
小心抽掉上清液
加入1毫升纯化液(Reagent M)
放进微型台式离心机离心5分钟,速度为16000g(或13000RPM,例如eppendorf 5415)
小心抽掉上清液
空气中晾干沉淀颗粒群
加入20微升缓冲液(Reagent N)
溶解后放进-20℃冰箱长期保存或移出2微升进行PCR反应
植物细胞或原生质体线粒体DNA分离(化学法)
实验开始前,将试剂盒里的净化液(Reagent C)冻融,然后移出1毫升净化液(Reagent C)和4毫升的裂解液(Reagent B)到15毫升锥形离心管里,混匀后,标记为裂解工作液,置入冰槽里备用。然后进行下列操作。
准备5 X 107植物细胞或原生质体
移入一个50毫升锥形离心管
放入台式离心机离心10分钟,速度为200g
小心抽去上清液
加入5毫升预冷的清理液(Reagent A),混匀细胞
放入台式离心机离心10分钟,速度为300g
小心抽去上清液
加入预冷的5毫升裂解工作液
涡旋震荡5秒,充分混匀
(选择步骤)超声波处理1分钟
在冰槽里孵育2分钟,期间涡旋震荡5秒一次
加入预冷的500微升强化液(Reagent D)
涡旋震荡5秒,充分混匀
在冰槽里孵育5分钟,期间涡旋震荡5秒二次(注意:参见注意事项8)
加入预冷的5毫升保存液(Reagent E),轻轻摇动试管混匀
放入4℃台式离心机离心10分钟,速度为1500g
小心移出上清液(注意:不要触碰沉淀物)到另一个新的预冷的15毫升锥形离心管(如果上清液含有肉眼可见的残渣,重复离心5分钟一次,速度为3000g)——此步骤去除细胞壁、淀粉颗粒、细胞核和未溶解的细胞以及完整质体等残渣
放入4℃超速离心机离心10分钟,速度为10000g
小心抽去上清液,保留沉淀颗粒——此步骤获得线粒体沉淀物(注意:如果暂时停止操作,须暂时放进-70℃冰箱里)
加入300微升破膜液(Reagent F)到线粒体颗粒样品中
涡旋震荡15秒,混匀颗粒群
转入1.5毫升离心管
置入冰槽中孵育15分钟
加入30微升去干扰液(Reagent G)
用200微升枪头上下抽吸混匀
放进37℃恒温水槽孵育15分钟
加入30微升酶解液(Reagent H)
涡旋震荡15秒
放进58℃恒温水槽或干式培养仪孵育2小时
置于室温下冷却15分钟,直至处于室温状态(或置于冰槽里15至30秒)
加入300微升萃取液(Reagent I)(注意:使用前摇匀)
涡旋震荡5秒
放进微型台式离心机离心5分钟,速度为16000g(或13000RPM,例如eppendorf 5415)
移出上层液相溶液到新的1.5毫升离心管(注意:切莫触碰液相交界面上的白色膜状物)
加入100微升浓缩液(Reagent J)到新的离心管
加入1微升助沉液(Reagent K)
加入800微升沉淀液(Reagent L)
在涡旋震荡仪上震荡5秒,充分混匀
放进微型台式离心机离心15分钟,速度为16000g(或13000RPM,例如eppendorf 5415)(注意:离心前做好方位标记,以便离心后观察管底沉淀颗粒)
小心抽掉上清液
加入1毫升纯化液(Reagent M)
放进微型台式离心机离心5分钟,速度为16000g(或13000RPM,例如eppendorf 5415)
小心抽掉上清液
空气中晾干沉淀颗粒群
加入20微升缓冲液(Reagent N)
溶解后放进-20℃冰箱长期保存或移出2微升进行PCR反应
注意事项
本产品为20次操作(1克植物组织或5 X 107细胞)
线粒体操作均须在4℃或以下状态下进行
操作时,须无菌操作,避免污染母液,尤其是裂解液(Reagent B)和保存液(Reagent E)
建议使用足够的组织或细胞量
建议植物组织使用组织匀浆器操作;德国的BRAUN细胞匀浆器最为理想
建议严格控制操作时间
通常匀化次数为80下(或细胞颗粒群/组织块状消失为止)达到80%的细胞裂解为理想状态,但不同的组织或细胞类型会存在差异。用户可以通过显微镜观察3微升匀浆物的细胞裂解程度:完整细胞呈现发亮的圆环。低于50%可以增加匀化次数。
通常孵育5分钟达到80%的细胞裂解为理想状态,但不同的组织或细胞类型会存在差异。用户可以通过显微镜观察3微升裂解物的细胞裂解程度:完整细胞呈现发亮的圆环。低于50%可以增加孵育时间和涡旋震荡次数
裂解液(Reagent B)具有吸附去除酚类物质的作用
不同组织,其线粒体含量不同;通常1克植物组织的线粒体含量为10至50微克线粒体蛋白
试剂中的溶液使用前摇匀;酶解液(Reagent H)需放进37℃冻温育许;为避免反复冻融,建议适量分装
通常1克植物组织或5 X 107细胞中提取的线粒体DNA达1至10微克
本产品所获得的线粒体DNA纯度和产量最为理想,确保无核DNA和外源性DNA污染
本公司提供系列植物线粒体分析技术产品