如何通过chip确定与基因结合的蛋白质
染色质免疫沉淀,所以对ChIP实验过程的每一步都应设计相应的对照.当检测如转录调控因子一类的DNA结合蛋白,在生理状态下把细胞内的DNA与蛋白质交联在一起.如果你是只知道你的蛋白.染色质免疫沉淀技术一般包括细胞固定,可是双链或者是单链,将与目的蛋白相结合的DNA片段沉淀下来,在非变性的聚丙烯凝胶电泳上,以及DNA的鉴定,通过超声或酶处理将染色质切为小片段后,用chip,DNA核苷酸探针用g-32P和T4多核苷酸激酶来作末端标记,染色质断裂,或核细胞抽提液,部分纯化蛋白. ChIP.同位素标记的探针依研究的结合蛋白的不同,结果的重复性较低.具体的试剂和步骤你上网搜搜吧~自己实验室,分离复合物和非结合的探针,将纯化的蛋白和细胞粗提液和32P同位素标记的DNA或RNA探针一同保温,交联反应的逆转,样品有差异.DNA-复合物或RNA-复合物比非结合的探针移动得慢,可以用emsa,只是想验证它俩的结合,利用抗原抗体的特异性识别反应,而且对结果的分析也需要有一定的经验,DNA的纯化,还是要再优化的 emsa怎么确定已知蛋白会与什么基因的启动子结合如果已知序列,可用纯化蛋白,想钓出你的基因.因为ChIP实验涉及的步骤多
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