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真菌RNA提取实验

2020.8.11

实验方法原理

液氮研磨可裂解细胞,促使核蛋白体的解离,使RNA与蛋白质分离,并将RNA释放到溶液中。当加入氯仿时,它可抽提酸性的苯酚,而酸性苯酚可促使RNA进入水相,离心后可形成水相层和有机层,这样RNA与仍留在有机相中的蛋白质和DNA分离开。

 

实验材料 菌丝体

试剂、试剂盒 NaCl蒸馏水SDSTris-HClEDTADEPCSSTE乙醇酒精酚:氯仿:异戊醇LiCl

仪器、耗材 液氮罐离心管离心机水浴锅冰箱紫外分光光度计电泳仪

实验步骤

一、实验试剂准备

 

1.  RNA提取缓冲液(CTAB):2% CTAB(W/V),2% 聚乙烯吡咯烷酮PVP(W/V),100 mM Tris-HCl(pH8.0,DEPC处理的水配置),25 mM EDTA,0.5 g/L 亚精胺Spermidine,2.0 M NaCl,2%巯基乙醇(V/V,使用前加入)。由于在高温灭菌条件下,Tris-HCl要和DEPC发生反应,所以配RNA提取缓冲液时直接用DEPC处理的水配制即可。

 

2.  SSTE:1 M NaCl,0.5% SDS(W/V),10 mM Tris-HCl pH8.0,1.0 mM EDTA。

 

3.  10 M LiCl 直接用蒸馏水配10 M LiCl,加1‰的DEPC过夜后,高温灭菌。


4.  DEPC处理水 用1‰的DEPC处理蒸馏水过夜,高温灭菌。

 

5.  3M NaAc,氯仿:异戊醇(24:1),酚(pH4.5):氯仿:异戊醇(25:24:1),无水乙醇,70%酒精。


二、实验步骤

 

1.  实验开始前将RNA提取液于65℃水浴锅中预热,离心管中加入ME(巯基乙醇),(10 mL加80 ul,50 mL中加入300 ul)。

 

2.  取约0.8 g菌丝体(液体培养获得的菌丝用真空抽滤即可,固体培养就更好说了),在液氮中迅速磨成精细粉末,装入50mL离心管,按1g材料8 mL的量加入预热的RNA提取液,颠倒混匀。

 

3.  65℃水浴3-10 min,期间混匀2-3次。

 

4.  加入等体积的酚(注意是酸酚pH4.5):氯仿:异戊醇(25:24:1)抽提(10 000 rpm,4℃,5 min)。

 

5.  取上清,等体积的氯仿:异戊醇(24:1)抽提(10 000 rpm,4℃,5 min)。

 

6.  加入1/4V体积10 M LiCl溶液,4℃放置6h以上(或过夜)。

 

7.  10 000 rpm,4℃离心20 min。


8.  弃上清,用500 ul SSTE溶解沉淀。

 

9.  酚:氯仿:异戊醇(25:24:1)抽提两次,氯仿:异戊醇(24:1)抽提1次(10 000 rpm,4℃,5 min)。

 

10.  加2V体积的无水乙醇,在-70℃冰箱沉淀30 min以上。

 

11.  12 000 rpm,4℃离心20 min。

 

12.  弃上清。沉淀用70%酒精漂洗一次,干燥。

 

13.  加200 ul的DEPC处理水溶解。

 

14.  用非变性琼脂糖凝胶电泳和紫外分光光度计扫描检测RNA的质量。

(在抽提过程中,若蛋白质含量或其它的杂质还较多,可以增加抽提次数。)

 

注意事项


1.  提取RNA请尽量在低温下操作,如果条件不容许,在室温下操作的时间要尽可能的短。


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