环状RNA研究文章汇总（一）
环状RNA“一站式”服务一直以来是云序生物的主打产品，严格的质控把关、严谨的实验设计、出色的生信分析以及贴心的售后服务造就了多项世界首篇环状RNA研究文章，受到了广大客户的一致好评。迄今为止，云序已经积累了超过10000例环状RNA测序的经验，样本覆盖20多个物种以及50多种疾病，客户发表文章达20篇以上，“云序制造”越来越多的出现在科研论文当中。
表1.云序客户环状RNA文章列表
自2013年的两篇在Nature期刊上对于环状机制研究成果问世以来，对于环状RNA的关注达到了空前的地步，迅速成为RNA领域最火热的明星分子之一。环状RNA相比于线性结构的mRNA分子，具有更稳定的环状封闭结构，因此在循环体系中环状的表达量更稳定。多篇文章已报道环状RNA可行使“microRNA海绵机制”，通过竞争性的结合miRNA间接影响mRNA，在多种疾病的发生发展中起到了重要的调控作用。环状RNA的研究从传统的“海绵机制”逐步发展多元化，更多的呈现出功能的多样性，如结合功能蛋白、编码蛋白潜能、影响可变剪切、受甲基化调控等。无处不在的功能覆盖让环状研究备受亲睐。新年伊始，云序生物公众号将为大家优中评优，悉数云序客户部分的环状RNA研究成果.
一、云序生物医口环状RNA文章
1.世界首篇红斑狼疮性肾炎环状RNA研究（影响因子：6.4）
环状RNA作为一种新发现的非编码RNA，在多种组织及疾病中发挥重要的生物学功能，然而关于其在红斑狼疮性肾炎中的研究鲜有报道。红斑狼疮性肾炎作为一种免疫缺陷性疾病，严重影响了患者的身体健康和生活质量。云序携手中国医科大学周华主任团队在Cell子刊“Molecular
Therapy Nucleic Acids”上发表重要研究成果，首次通过全转录组测序构建了该疾病的环状RNA表达谱，并从313条差异表达结果中挑选感兴趣的环状RNA--CircHLA-C。前期，作者发现miR-150在该疾病中发挥着重要的调控作用，通过生信预测结果显示该环状能够通过竞争性吸附miR-150。
2. 世界首篇小鼠肠道电离辐射环状RNA变化研究（影响因子：5.5）
中国医学科学院放射医学研究所刘强团队利用云序生物提供的全转录组测序服务成功揭示了circRNAs在小鼠空肠辐射后表达的变化，为研究circRNAs在辐射致肠损伤中的作用提供了靶分子。高质量的测序技术对每一个环状的表达都做到精准检测，生信分析可视化从宏观角度（染色体分布、成环位置）给出了所有对于放射处理后在小鼠空肠组织当中环状RNA分子的表达情况。筛选差异表达的环状RNA进行环状RNA定量PCR验证，GO分析揭示包括结合、催化、细胞因子和细胞分泌等GO条目均发生富集。KEGG分析预测结果显示差异环状RNA的靶基因与MAPK信号通路相关，理论与预测完全相符。海绵机制预测ceRNA网络图，按照海绵机制的反式调控方式，该网络中包括42个上调和48个下调的环状RNA分子，以及预测相互结合的22个靶基因mRNA。
3.世界首篇小鼠脑创伤模型外泌体RNA研究（影响因子：5.2）
本研究作者真正集合了外泌体和环状RNA两大科研热点，利用云序生物提供的全转录组测序服务揭示大脑创伤外泌体中环状RNA的变化及其潜在的生物学功能。研究人员首先分离小鼠脑组织提取脑周质外泌体，通过外泌体全转录组测序检测TBI脑周组织外泌体中环状RNA的表达变化。结果发现231个差异表达的环状RNA，其中155个上调，76个下调。接下来通过生信分析如GO及KEGG分析对外泌体差异表达的环状RNA进行了功能预测。GO分析表明这些RNA分子主要参与神经损伤修复、神经系统发育和神经信号传导等功能条目，这些分子同时主要富集在Cgmp-PKG信号通路。CircRNA-miRNA互作网络图揭示了作用的靶miRNA及可能的功能。本研究首次揭示了大脑创伤外泌体中环状RNA变化，为后续分子机理详细研究提供诸多靶分子，也为大脑创伤的干预治疗提供潜在的靶点。
图3：GO Pathway分析显示环状来源基因富集到Cgmp-PKG通路和神经投射等功能
4.世界首篇胰腺癌吉西他滨耐药机制中环状RNA研究（影响因子：3.8）
吉西他滨是一种晚期胰腺癌重要治疗药物，在疾病治疗过程中起重要作用。本篇文章作者首先获得吉西他滨的耐药细胞株，通过全转录组测序手段对比耐药细胞株和正常细胞株中环状RNA的表达谱。作者选取差异表达前10的环状RNA进行环状RNA定量PCR验证测序结果，准确性高达100%，说明测序结果真实可靠。
