关注公众号

关注公众号

手机扫码查看

手机查看

喜欢作者

打赏方式

微信支付微信支付
支付宝支付支付宝支付
×

DNA测序技术操作的注意事项

2022.4.06

   1、测序所用模板DNA的量一般按下面要求加入:

  模板种类/长度 模板量

  200bp (PCR产物) 16ng(120fmol)

  3000-5000bp(超螺旋质粒DNA) 4mg (2pmol)

  48000bp(λ,粘粒DNA) 1mg(31fmol)

  由于超螺旋质粒产生的信号比松弛的线性双链DNA弱,因此使用超螺旋质粒作为模板时其用量要比其它模板大一些。

  2、计算与4.5pmol相当的引物纳克数可用以下一般公式:

  4.5pmol=1.5ng×n,其中n为引物碱基数

  计算与1pmol相当的引物微克数可用以下一般公式:

  dsDNA:1pmol=(6.6×10-4 mg)×n,其中n为模板碱基对数

  ssDNA:1pmol=(3.3×10-4 mg)×n,其中n为模板碱基数

  3、为阻止Taq DNA聚合酶延伸非特异性退火引物, 热循环仪必须预热至95℃。温度变换应越快越好。下面的循环时间不包括变温时间。如果你无法确定使用何种模式,建议从模式1开始。

  模式1:适用于引物<24碱基或GC含量<50%

  95℃ 2分钟。然后: 95℃ 30秒(变性), 42℃ 30秒(退火), 70℃ 1分钟(延伸)。

  模式2:适用于≥24碱基或略短的GC含量≥50%的引物。

  95℃ 2分钟, 然后: 95℃ 30秒(变性), 70℃ 30秒(退火/延伸)。 4. 在加入终止溶液之后样品可在4℃保存过夜。

推荐
热点排行
一周推荐
关闭