人类蛋白质组芯片在发现新的胃癌血清标志物中的应用
据WTO统计，2012年全球新发胃癌95.2万、死亡72.3万，发病率和死亡率分居所有恶性肿瘤的第二、第三位，在中国平均每分钟就有3人死于胃癌。根据近30年对瑞金医院胃癌患者生存率的统计，早期治疗后5年生存率为90%以上，而晚期则不足10%，因此胃癌的早期诊断具有重大现实意义。而目前常用的胃癌肿瘤标志物，如癌胚抗原（CEA）等的特异性和灵敏度均不高，因此急需采用新的技术平台来筛选胃癌诊断标志物。
利用HuProtTM人类蛋白质组芯片，上海交通大学的科研团队成功地找到多个高特异、高灵敏度的胃癌血清标志物，这一研究成果于11月23日在蛋白质组学专业杂志Molecular & cellular proteomics（MCP）上在线发表。
蛋白质芯片具有高通量、可平行分析的特点，特别适合用于寻找包括肿瘤在内的各类与免疫相关疾病的血清标识物。在该研究中，研究者以胃癌为对象，采用包含约17,000种蛋白质的人蛋白质组芯片分析了37例胃癌患者、50例健康人的血清，找到了44种差异表达的自身抗体。然后采用这44种抗体所对应的蛋白定制芯片并扩大样本量进行第二轮筛选。实验中选取300例胃癌、314例胃癌高危、300例健康人血清，最终得到7个候选生物标志物。之后采用各300例胃癌和健康人的血清，以COPS2和CTSF为例进行了ELISA验证。作者选取了胃癌和其他消化道肿瘤的组织进行免疫组化分析，发现CTSF在胃癌组织中的表达量明显高于其他组，具有胃癌特异性。基于标志物与胃癌患者生存率的相关性分析，发现其高表的患者5年生存率显著高于低表达患者。该项研究筛选出的7个胃癌血清标志物对于胃癌诊断的敏感性、特异性和准确性，均明显高于目前临床上常用的单个或多个传统标志物联用的诊断方法（CEA、CA25、CA72-4、CA9），显示出很高的胃癌筛查和早期诊断的临床应用价值。
该项研究建立的基于蛋白质组芯片的血清标识物发现流程具有通用性，可方便地移植于其它肿瘤和免疫相关疾病的血清生物标识物的系统性发现。所发现的血清生物标识物在胃癌早期诊断和预后预测方面具有显著的产业化潜力。该项研究目前已获得7份授权ZL，正积极与相关企业开展合作，努力推动本项成果的转化应用，期望能尽快造福胃癌患者。
HuProtTM人类蛋白质组芯片源自美国约翰·霍普金斯大学，含有~20,000个人全长重组蛋白质，是目前最高通量的人重组蛋白质芯片。目前已应用于多个研究领域，如血清标志物发现、蛋白-蛋白相互作用（PPI）、蛋白-小分子、蛋白-RNA/DNA相互作用以及翻译后修饰等通路和功能的研究。
