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缺口平移法为例介绍DNA探针的标记方法

2022.11.16

缺口平移法是最常用的探针标记法,反应体系的主要成分有DNA酶I(DNase I)、大肠杆菌DNA聚合酶I(DNA polymerase I)、三种三磷酸脱氧核糖核苷酸、一种同位素标记的核苷酸(如dATP、dTTP、dCTP,”P—dGTP)。

首先用适当浓度的DNA酶I在探针DNA双链分子上随机切开若干个缺口(不是切断DNA或将其降解),然后再借助于DNA聚合酶I的5 '→3'的外切酶活性,切去5’末端的核苷酸;

同时又利用该酶的5’→3’聚合酶活性,使32P标记的互补核苷酸补入缺口.DNA聚合酶I的这两种活性的交替作用,使缺口不断向3’的方向移动,DNA链上的核苷酸不断为32P标记的核苷酸所取代。

由于反应体系中含有同位素标记的单核苷酸,使新合成的链带有同位素标记,所以缺口平移实际上是同位素标记的核苷酸取代了原DNA链中不带同位素的同种核苷酸。

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