Southern 杂交技术-1
Southern技术是指以Southern名字命名的DNA转移杂交技术。它可用于基因组特定DNA序列的定位,可以测定相关片段的同源性、可以从c库、基因组文库中筛选完整基因等。用一种或多种限制性内切酶对基因组DNA加以切割,通过琼脂糖凝胶电泳分离酶切片段,随后,使DNA在原位变性,并从凝胶转移至固相膜,用已知核苷酸片段加以标记作为探针,通过分子杂交来检测待测样品中是否存在互补的核酸序列。该技术已成为分子生物学中一类重要的检测手段。下面分别介绍利用光敏生物素试剂盒及DIG试剂盒进行杂交的方法。
十五-1:光敏生物素试剂盒杂交实验
一仪器:分子杂交仪、摇床、 烤箱、取液器、电泳仪、电泳槽
二试剂:硫酸葡聚糖钠盐(可不用)、聚乙烯吡赂啉酮(PVP)、聚蔗糖、牛血清白蛋白(BSA)、100mM EDTA、3MnaAC、无水乙醇、电泳缓冲液、切变性鲱鱼精DNA(100ug/ml)
20×SSC溶液 氯化钠 3M 预杂交液 6×SSC
柠檬酸三钠 0.3M (含100ug/ul变性鲱鱼精DNA)
pH 7.0 5×Denhardt's 溶液
0.5%SDS
变性液 0.5M NaOH 中和液 1M Tris-HCL pH 7.4
1.5M NaCL 1.5M NaCL
封闭液 3gBSA溶于70ml水中,浓盐酸调pH至3.0,煮沸20分钟后,冷至室温,NaOH调pH至7.5,加入10ml以下缓冲液(1M
Tris-HCL pH7.5, MgCL2 0.19%, NaCL 5.8%, Triton X-100 0.05ml)定容至100ml
50×Denhardt's 溶液 1%PVP 1M PBS NaCL 0.8% pH 7.4
1%BSA KCL 0.02%
1%聚蔗糖 Na2HPO4 0.144%
KH2PO4 0.024%
洗涤液
A:2×SSC,250ml中含0.1%SDSB:0.1×SSC,250ml中含0.1%SDS
C:Tris-HCL 100mM pH 7.5 D:Tris-HCL 100mM
NaCL 1M NaCL 0.5M
MgCL2 2mM Tween 20 0.5% pH 7.5
Triton X-100 0.05%
亲和素-碱性磷酸酶溶液 Tris-HCL 100mM
NaCL 1M
MgCL2 2mM
Triton X-100 0.05%
pH 7.5
碱性磷酸酶2-3单位/ml
底物溶液 Tris-HCL 100mM pH 9.5 终止液
NaCL 100mM Tris-HCL 10mM
MgCL2 5mM EDTA 1mM