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从RNA抽提到电泳鉴定-2

2020.9.07

逆转录(RT)
一,准备工作
1, 实验器具与材料:
(1)移液枪:200ul、10ul
(2)吸头:200ul、20ul
(3)EP 管1.5ml、100ul
(4)水浴箱
2,实验器具的处理与准备
塑料制品:(包括吸头、EP管等)
将塑料制品逐个浸泡于 1‰DEPC水中(必要时小枪头需要用吸管打入DEPC水)37℃过夜,然后送至高压3次,后在80℃烘烤箱中烘干(或置于37℃中8小时左右烘干),试验前将枪头放入吸头台。
3,试剂配制和准备:
(1)DEPC水:泡实验器具的DEPC水的配制:1000ml双蒸水中加1mlDEPC,放在1000ml容量瓶中静置4小时后备用。逆转录中所用的DEPC水的配制:100ml盐水瓶内装40ml双蒸水,加40ulDEPC,37℃过夜,送至高压,后分装到几个1.5mlEP管中,-20℃中保存备用。
(2)RT中所需要的各种试剂
(3)引物浓度计算方法: (新合成的引物的稀释) 假如终浓度为X uM(pmol/ul) 加DEPC水体积(ul)=(OD×33×1000000)/(分子量×X)
二,RT 时注意事项:
为避免RNA酶污染,在RT中仍要佩戴一次性手套和口罩。
三,RT步骤
用 SSⅢ逆转录酶进行RT(20ul体积)
1, 准备0.65ml的EP管
2, 冰上操作:在EP管中加入10ulDEPC水,1ul引物,1ul模板RNA,1uldNTP,短暂离心。
3, 65℃水浴5分钟后,立刻0℃冰水浴至少1分钟。
4, 短暂离心后,冰上操作:加入4ul 5×First-Strand Buffer,1ul 0.1MDTT,1ul RNAse Inhibitor,1ul SSⅢ逆转录酶。
5, 短暂离心
6, 50℃水浴60分钟进行逆转录。
7, 70℃水浴15分钟灭活逆转录酶
8, -20℃保存,或立即进行PCR。
用AMV逆转录酶进行RT(10ul体积)
1, 准备0.65mlEP管
2, 加入4.5ul DEPC水,1ul引物,1ul模板RNA
3, 稍离心,100℃沸水裕1min
4, 加入0.5uldNTP,2ul 5×Buffer,1ul AMV逆转录酶
5, 稍离心,封口膜封口,42℃水浴90℃作RT
6, 100℃沸水裕3min灭活AMV
7, 立即PCR或-20℃保存。
聚合酶链式反应(PCR)
二,准备工作
8, 实验器具与材料:
(1)移液枪:200ul、10ul
(2)吸头:200ul、20ul
(3)吸头台:放置200ul和 20ul的吸头一个
(4)EP管1.5ml、100ul
2,实验器具的处理与准备
(1) 塑料制品:(包括吸头、EP管等)
送至高压3次,试验前将枪头放入吸头台。
3, 试剂配制和准备:
(1) 双蒸水: 100ml盐水瓶内装40ml蒸馏水,送至高压,后分装到几个1.5mlEP管中,-20℃中保存备用。
(2) PCR中所需要的各种试剂
三,PCR 时注意事项:
佩戴一次性手套,同时避免戴上的一次性的手套接触可疑污染物。
四,PCR步骤
1, 准备100ul EP管
2, 依次在管中加入:(50ul反应体系)
ddH2O 37.5ul ×?
10mM dNTP 1ul ×?
10×PCR buffer 5ul ×?
25mM Mgcl2 (加之前要摇匀) 3ul ×?
上游引物 1ul ×?
下游引物 1ul ×?
模板cDNA 1ul

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