转座因子驱动癌基因在人类癌症中广泛表达
近日，华盛顿大学医学院等科研人员在Nature Genetics上发表了题为“Transposable elements drive widespread expression of oncogenes in human cancers”的文章，发现转座因子驱动癌基因在人类癌症中的广泛表达。
转座因子是一种数量丰富的调控序列遗传资源。在癌症中，转座因子中的隐蔽调节单元可以通过表观遗传被重新激活从而影响肿瘤发生，这一过程称为onco-exaptation。但是，转座因子onco-exaptation过程的发生及其影响在不同癌症类型之间的区别仍不清楚。在本研究中，科研人员对15种癌症类型的7769个肿瘤和625个正常数据集进行了分析，确定了129个转座因子中的启动子激活事件，涉及3864个肿瘤的106个致癌基因。此外，科研人员还对AluJb-LIN28B候选基因进行了研究。Alu是人类基因组中大量存在的转座因子，AluJb是Alu序列的亚科，当Alu插入到基因组中时，产生替代的启动子来激活致癌基因LIN28B。在癌细胞中敲除AluJb可以抑制癌基因的表达，而动态DNA甲基化调节了启动子的活性，说明了转座因子对癌基因的激活的必要性和充分性。这一研究揭示了多种癌症类型中存在转座因子onco-exaptation过程，并说明这一过程与癌基因激活以及最终导致肿瘤发生的复杂机制有关。
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