lncRNA功能机制研究（一）
文章导读
LncRNA是长度大于200nt的长链非编码RNA，在调控不同的分子过程中发挥着重要作用。其主要功能不仅可以与功能蛋白结合，并在转录或转录后水平调控基因表达，而且lncRNA也可以作为诱饵，吸附miRNA，调节miRNA调控的靶基因表达。但是，目前关于lncRNA在胃癌中的表达谱和生物学功能的了解仍然有限；在本研究中，作者首先通过生物信息学分析胃癌lncRNA微阵列数据库，发现LINC0034在胃癌中显著高表达，且与胃癌具有临床相关性，结果显示显示LINC00346在胃癌中反复扩增上调，其表达与病理分期差、肿瘤体积大、预后差呈正相关。然后探究了 LINC00346的体内外功能，实验显示LINC00346能够影响胃癌生长、迁移和侵袭等生物学功能。作者也探究了LINC00346调控胃癌发展的上下游分子机制，上游机制显示致癌转录因子KLF5和MYC可与LINC00346启动子结合，并增强其表达；下游机制显示LINC00346主要表达在胞质中，可通过ceRNA机制作为miR-34a-5p的分子海绵体，并通过吸附miR-34a-5p后调节其下游靶基因CD44、AXL、NOTCH1的表达并调控胃癌细胞的生物学功能。
综上所述，该研究结果证明了KLF5、MYC/LINC00346/miR-34a-5p在胃癌发生发展中起关键作用的模型，为胃癌治疗提供了新方向和思路。
发表期刊：Cell Death & Differentiation
影响因子：8.0
实验方法：生信高级分析，转录组RNA测序，RIP，pulldown
测序样本：过表达LINC00346的胃癌细胞（实验组），转染空载质粒的胃癌细胞（对照组）
文章内容
1. 生物信息学分析胃癌lncRNA微阵列数据库，现LINC0034在胃癌中显著高表达，且与胃癌具有临床相关性
实验路线
结果：LINC0034具有胃癌临床相关性
a,b：LINC0034在胃癌中显著高表达；c-d：LINC0034的表达与病理分期差、肿瘤体积大、预后差呈正相关。
2．探究LINC00346在胃癌中的体内外功能
实验路线
结果1：体外探究LINC00346对胃癌细胞增殖、迁移和侵袭功能影响
a-b．克隆形成实验探究细胞增殖能力；c. 流式细胞术实验探究细胞周期组织情况；d. EDU免疫荧光染色实验探究细胞增殖能力；e. Transwell和invasion实验探究细胞迁移和侵袭能力。
结果2：体内探究LINC00346对胃癌在体内的生长和转移的影响
a-h：裸鼠成瘤实验
3．探究LINC00346调控胃癌发展的上下游分子机制研究
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焦点事件
