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原位杂交实验要求及步骤(二)

2020.7.21

三、操作步骤

(一)取材、冰冻切片:
将动物以3%戊巴比妥钠麻醉,打开胸腔,暴露心脏,刺破右心耳,将针尖刺入左心室用生理盐水灌注(灌注量约为动物体重的2倍),再注入等量的4%多聚甲醛。(见图2-7)。取材,置于4%多聚甲醛中后固定4hr。以0.1M PBS浸泡冲洗4-5次(换液:1次/hr)。将组织块入30%蔗糖/0.1M PBS液(4℃),1-2天后冰冻切片,将切片裱贴于原位杂交专用玻片上,切片厚度为15-20μm。

(二)探针制备与检测(定量):
1.随机引物制备cDNA核酸探针
以DIG DNA 标记检测试剂盒为例:
(1)探针制备:
①模板DNA(0.5-3μg) 15μl,100℃变性10min,冰浴5 min。
②在冰浴中加:Hexanucleotide mix 2μl, dNTPmix 2μl, Klenow Enzyme 1μl,反应总体积为20μl。37℃孵育过夜。
③在上述20μl的标记产物中加4M LiCl 2.5μl, 75μl(无水乙醇预冷),轻轻混匀,-20℃放置 2hr。4℃离心12000g×15min,弃上清。70%乙醇(预冷) 50μl洗涤,7500g×5min,弃上清,晾干沉淀,加TE 50μl溶解沉淀,-20℃保存备用。
(2)探针敏感性检测:
①样品稀释:取dig-标记探针1μl 用ddH2O以1:10、1:100、1:1000、1:1000、1:10000梯度稀释。
②取一张与点样器大小相近的尼龙膜,标记方向,ddH2O中浸泡 1min,6×SSC中浸泡10min,置点样器上,负压抽吸5min。
③将上述样品点于尼龙膜上,继续抽吸10min。
④取下尼龙膜,置紫外灯下10cm处照射5min,晾干。
⑤将膜置于适量预杂交液(5-10 ml)中,37℃预杂交10min。
⑥加入Anti-dig 抗体(1:5000),37℃杂交30min。
⑦洗膜:2×SSC/0.1%SDS室温洗10 min×2次。
⑧显色:15 mlTSM2中加300μl显色液(NBT/BCIP),37℃避光显色30min。

1. PCR法制备cDNA核酸探针:
(1) 探针制备:
以PCR DIG Probe Synthesis Kit 为例:
在0.5ml离心管中,依次加入:
PCR 引物 1(10pM) 2μl
PCR 引物 1(10pM) 2μl
质粒DNA 模板(10-100pg) 2μl
PCR DIG mix 2μl
(含dNTP和DIG-11-dUTP)
dNTPmix 2μl
10×PCR buffer 5μl
Taq 酶(2u/μl) 1μl
加入适量ddH2O,使总体积达50μl。
① 将上述混合液稍加离心,立即置PCR仪上,执行扩增。一般:在93℃预变性3-5min,进入循环扩增阶段:93℃ 45s → 58℃ 45s → 72℃ 60s,循环30-35次,最后在72℃ 保温7min。
② 在上述PCR产物中加入4M LiCl 12.5μl、预冷无水乙醇375μl,轻轻混合后置于-20℃2hr, 12,000g×15min,弃上清。70%乙醇(预冷) 120μl洗涤沉淀,离心7500g×5min,弃上清,晾干沉淀,加TE 50μl溶解,-20℃保存备用。
(2)探针检测:
行琼脂糖凝胶电泳,紫外灯下观察DIG-DNA探针含量(采用目测法)。

(三)原位杂交反应(以DIG-cDNA探针为例):
1.0.1M PBS (pH 7.2) 浸 5-10min。
2.0.1M甘氨酸/0.1M PBS 浸5min。
3.0.3%TritonX-100/0.1M PBS 浸10-15min。
4.0.1M PBS 洗 5min×3次,加蛋白酶K(1μg/ml),37℃孵育30 min。
5. 4%多聚甲醛浸5min。
6. 0.1M PBS 洗 5min×2次,浸入新鲜配制的含0.25%乙酸酐/0.1M三乙醇胺中10min。
7.预杂交:滴加适量预杂交液,42℃ 30 min。
1. 杂交:倾去预杂交液,在每张切片上滴加10-20μl杂交液(将探针变性后稀释在预杂交液中,0.5 ng/μl ),覆以盖玻片或蜡膜,42℃ 过夜。(阴性对照
2. 洗片:
(1) 4×SSC、2×SSC、1×SSC、0.5×SSC 37℃各洗20min;
0.2×SSC 37℃洗10min;0.2×SSC与0.1M PBS各半洗10min;
0.05M PBS 洗 5min×2次。
10.3% BSA/0.05M PBS 包被,37℃ 30min.
11. 滴加抗地高辛-抗血清碱性磷酸酶复合物(以抗体稀释液1:5000稀
释)4℃孵育过夜。
12. 0.05M PBS洗15min×4次; TSM1 10min×2次; 新鲜配制TSM2 10min×2次。
13. 显色:在玻片上滴加适量显色液,4℃避光过夜。
14. 将玻片置于TE中10-30min以终止反应。酒精梯度脱水、二甲苯脱脂,中性树胶封片。
15.显微镜下观察结果。四、注意事项:

1. 作为DNA-RNA的杂交,需防RNase的污染。
cDNA探针在杂交时必须变性解链。具体方法是:将探针置100℃加热5min,冰浴骤冷。

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