Nature评最值得关注技术之一!探究空间代谢组学的奥秘,从研究手段到实际应用最全指南,免费领取权威资料!
多组学技术近年来越来越被广泛用到众多高分文章中,传统的组学主要包括指基因组、转录组、蛋白质组以及代谢组。近两年,打破传统维度探索视角,空间组学应运而生,将二维组学信息扩展到了三维水平, 这一技术更是被 Nature 评价为 2022 最值得关注的七大榜单技术。
在科研人的极力追捧下,空间代谢组学应运而生,频频上榜高分杂志。如此被认可,它到底凭什么呢?
如果你也对空间代谢组学感兴趣,想要了解它的发展、技术及应用, 鹿明生物联合丁香实验上线了「质谱成像之空间代谢组研究」专题,里面有丰富的「视频、干货、经验」可供参考。 今天参与活动,免费领取电子资料!
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空间代谢组学是基于 质谱成像技术发展而来的, 免标记、无需基质、周期短。通过质谱成像技术对不同组织器官中的代谢物进行 定性、定量、定位三个维度的分析,突破传统代谢组单维度研究损失空间信息的瓶颈,揭示代谢组在组织中的空间分布,直接阐明代谢物 三维度信息:是什么(定性),有多少(定量),在哪里(定位)
去年 6 月 Cell 杂志更是重磅推出一篇关于代谢组学发现、诊断与应用的综述。里面提到 「空间代谢组的应用使得探索单一细胞群和亚细胞区室的代谢特征成为可能,使研究人员能够在复杂的整体代谢环境中关注到不同的代谢区域 」
空间代谢组学不仅功能强大, 应用也十分广泛,赶紧看看下面有没有自己的研究领域抓紧应用起来。
首先是医学领域:
• 疾病分子机制,如阿尔茨海默症、抑郁、脑缺血、糖尿病、心血管疾病等;
• 生殖发育学,如胚胎、器官发育过程中代谢调控和代谢表型等;
• 肿瘤代谢与肿瘤免疫,如肿瘤代谢微环境与肿瘤免疫逃逸等;
•肿瘤分子病理诊断、分子分期/分型、 生物标志物筛选等;
•肿瘤耐药与精准用药研究等;
•环境毒理学,如环境污染物的体内毒性效应和分子机制等;
•新药药理和毒理,如 药物的空间分布和体内效应和分子机制等。
其次是农林牧渔领域:
•发育学,如种子、胚胎、器官发育过程中的 空间代谢调控等;
•分子机制,如盐胁迫、病毒/真菌侵染、光合作用等机制研究;
•基因调控机制,如转基因、基因沉默、基因敲除后代谢物变化的机制研究,了解 基因与代谢物之间的精确关系等;
• 植物与环境互作研究,如昆虫选择性侵害植物部位、土壤与根部互作研究等;
•植物药用成分定位。
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空代仪器平台
已搭建2套AFADESI-MSI质谱成像系统+1套Waters DESI-MSI质谱成像系统
项目执行
已落地执行项目百余项、检测组织样本类型20+;
定性算法经过多维校准
定性结果同时考虑物质表达空间情况、加和离子及同位素峰表达强度相似性、同位素表达空间分布相似性、非靶向质谱数据和空代自建数据库进行校准。
项目实测结果
可实现定性代谢物数量:1000-3000个代谢物
无偏好性检测代谢物::70%为700Da以下的小分子物质,30%为脂质类物质,更加适合代谢组学研究方向;
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END
Alice 撰文
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