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16s rrna测序技术

2019.3.12

rna测序已经在生物学和医学的各个领域取得了前所未有的发展。在包括癌症在内的诸多疾病中,转录异构体的表达和用途是健康组织和患病组织之间变异的重要来源。鉴定差异剪接的异构体和融合转录本,可以为疾病的诊断和治疗提供信息。rna测序还有助于揭示从单细胞到整个组织的转录组动力学。同时,cdna测序也极大地辅助了病毒性病原体的表征和及时检测。

毫无疑问,传统的测序技术使全面转录组分析成为可能,并带来了很多重要的科学发展。然而,这一领域仍有重要的局限性有待解决。

转录本的长度通常为几千碱基对,这使得现有的短读长序列仅能部分覆盖转录本的长度,因此依赖计算重构准确的异构体组装非常困难,短读长也表现出高比率的多重定位。

基于测序的rna分析均需要将 rna转化为互补dna(cdna)链,在这一过程中,逆转录或扩增可引入偏倚,产生gc偏好性。由于并非所有的转录物都以相同的效率扩增,会导致一些种类的rna的中断以及......

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扩增子测序是指对16S rDNA/18S rDNA/ITS/功能基因等特定区段PCR产物进行高通量测序,突破传统微生物不可培养的缺点,获得环境样本中的微生物群落结构、进化关系以及微生物与环境相关性等信息。

。16S rRNA基因序列包括9个可变区和10个保守区,保守区序列反映了物种间的亲缘关系,而可变区序列则能体现物种间的差异。扩增子测序主要对特定长度的PCR产物进行测序分析,针对环境样本,16S测序是研究

,通过软件系统得到试验结果。 技术特点-基于qPCR 技术-容易使用,3个小时可出结果-使用多种支原体的16S rRNA 基因具有高度特异性引物、探针。-无需大型设备应用Microsart