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基因组文库的扩增实验

2020.8.10

实验方法原理 通过平板培养可对重组噬菌体文库进行扩增,平板培养的原种可直接来源于本方案所述的包装混合物。但只要可能,该扩增过程可被省略,而感兴趣的 DNA 序列可从原始文库直接筛选。扩增将不可避免地降低文库的复杂性,部分原因在于在连续几轮的噬菌体生长中,对生长缓慢的重组噬菌体来说是十分不利的。

实验材料 λ 噬菌体文库大肠杆菌铺平扳细菌

试剂、试剂盒 氯仿SM

仪器、耗材 LB 或 NZCYM 琼脂平板Sorvall SS-34 或相当型号加热设备或水浴

实验步骤

一、材料


1. 缓冲液和溶液


氯仿


SM


2. 培养基


LB 或 NZCYM 琼脂平板(150 mm)


LB 或 NZCYM 顶层琼脂糖


3. 离心机和转子


Sorvall SS-34 或相当型号


4. 专用设备


预置于 47℃ 的加热设备或水浴(用于顶层琼脂糖)


5. 载体和菌株


λ 噬菌体文库


大肠杆菌铺平扳细菌


二、方法


1. 为了扩增 λ 噬菌体文库,将含 10000~20000 个重组噬菌体的 50 μl 或更少体积的多个包装混合物组分与 0.2 ml 铺平板细菌在 13X100 mm 试管中混匀,37℃ 温育 20 min。


2. 加 6.5 ml 已熔化的 47℃ 的琼脂或琼脂糖至感染细胞的第一个试管中,通过轻拍或温和地涡旋振荡混匀,立即倒入新鲜灌制的 150 mm 平板内的底层琼脂上。对余下的感染细胞重复该过程。


3. 将平板于 37℃ 最长放置 8~10 h。


4. 将平板中加入 12 ml SM ( 如果用烤盘,则加 150 ml), 4℃ 水平放置过夜。


5. 将所有平板中的 SM 都收集至一个单独的无菌聚丙烯离心管或瓶子中。每个平板再加 4 ml SM 进行冲洗,与最初回收的 SM 液合并。加入 0.2 ml 氯仿至回收的扩增噬菌体培养物中,室温放置 15 min,并偶尔轻轻摇晃使氯仿裂解所有的感染细胞。


6. 4℃ 4000 g ( 5800 r/min 在 Sorvall SS-34 中)离心 5 min,去掉细胞和琼脂糖碎片。


7. 将上清转移至新的无菌试管或瓶子中。将扩增噬菌体文库分成数个组分,4℃ 保存。用噬菌斑分析测定文库滴度。


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