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基因扩增实验室要求

2021.11.28

对 PCR 实验进行严格设置的惟一目的就是为了避免污染。原则上临床基因实验室应分为四个隔开的工作区域,并且每一区域都应有专用的仪器设备,即
①试剂贮存和准备区;
②标本制备区;
③扩增反应混合物配制和扩增区;
④扩增产物分析区。如使用扩增和产物检测同时完成的荧光定量 PCR 方法,或全自动分析仪法如 CobasT9 (Amplicor)等,则③和④两个区可合并。
与上述特定实验区有关的各个房间必须有明确的标记,以免不同工作区内的设备物品如加样器、试剂等的移出或不同的工作区间发生混淆。进入各个工作区必须遵循一严格的顺序,只能按单一方向进行,即从试剂贮存和准备区→标本制备区→扩增反应混合物配制和扩增区→扩增产物分析区。建议不同的工作区使用不同的工作服(例如不同的颜色),从而可以直接从工作服的颜色判断工作人员所应在的工作区,避免潜在的污染。此外,当工作人员离开各工作区时,不得将各区特定的工作服带出。
所有进入实验区的人员都必须遵循实验室进入程序和顺序,不同的实验区应有其各自的清洁用具以防止交叉污染。

1、试剂贮存和准备区
本区用于贮存溶液的制备,溶液的分装和主反应混合液的制备。
本区仪器设备配置:
①4℃冰箱和20℃冰柜;
②混匀器;
③微量加样器若干支(覆盖1~1000μL);
④专用工作服和工作鞋;
⑤专用办公用品;
⑥消耗品,如一次性手套,一次性吸水纸,耐高压处理的离心管和加样器吸头(带滤心);
⑦可移动的紫外灯(近工作台面)
注意事项:工作结束后应立即对工作区进行清洁。如果已在其他工作区尤其是扩增产物分析区工作过,则不能进入本区。

2、标本制备区
标本贮存,核酸提取及贮存均在本区内进行,RNA 测定时的单链 cDNA 合成也在本区进行。
本区仪器设备配置:
①4℃冰箱和-20℃或-70℃冰柜;
②高速台式冷冻离心机;
③混匀器;
④水浴箱或加热模板;
⑤微量加样器若干支(覆盖1~1000μL);
⑥专用工作服和工作鞋;
⑦专用办公用品;
⑧消耗品,如一次性手套、一次性吸水纸、耐高压处理的离心管和加样器吸头(带滤心);
⑨可移动的紫外灯(近工作台面);
⑩超净工作台;
⑪超声波水浴(处理大分子 DNA 适用)。
注意事项  本区的试剂和消耗品不能带入扩增加样区,因其可能会被未扩增的核酸污染。同样,剩余的主反应混合液,酶或试剂不能再拿回至试剂贮存和准备区。由于可能会发生气溶胶所致的污染,所以应避免在实验室内不必要的走动。从邻近区进入标本制备区的气溶胶的污染可通过在实验室设立正压条件而减少。为避免样本间的交叉污染,加入待测核酸后,必须盖好反应管盖。对具有潜在传染危险性的材料,必须有明确的标本处理和灭活规定,用过的加样器吸头必须放入专门的消毒(例如含次氯酸钠溶液)容器内。实验桌椅表面每次工作后都要清洁,实验材料如出现外溅则必须作出记录。

3、扩增反应混合物配制和扩增区
模板材料(来自标本制备区)加入主反应混合物(来自试剂贮存和准备区)以及扩增反应等专门在本工作区内进行。在巢式 PCR 测定中,通常在第一轮 PCR 后须打开反应管。因此巢式 PCR 有较高的污染危险性,必须特别重视。本工作区设置对于巢式PCR测定来说是必不可少的。
本区仪器设备配置:
①核酸扩增仪;
②微量加样器(覆盖1~1000μL);
③专用工作服和工作鞋;
④专用办公用品;
⑤消耗品,如一次性手套、一次性吸水纸、耐高压处理的离心管和加样器吸头(带滤心);
⑥可移动紫外灯(近工作台面);
注意事项  不能从本区再进入任何“上游”区域,建议降低本区的气压以免气溶胶从本区漏出。为避免气溶胶所致的污染,工作应事先安排好,并尽量减少实验室内的走动。加样应在通风橱内进行,打开预处理过的反应混合液必须小心,尤其是在巢式 PCR 步骤之间。一个简单的方法是在打开前对反应管内的液体快速离心一下,可使用体积非常小的离心机,因为其所占实验台面小,易于用一只手操作,适合于大多数实验室。防潮屏障如石蜡油或轻矿物油也具有防污染作用,但必须注意的是矿物油本身也可能成为一种持续的污染源,用过的加样器吸头必须放入加有消毒液的容器中。
对于巢式 PCR 开盖时,必须小心以防反应液溅出,因此在开盖前最好离心一下。加样时应在一通风橱中打开反应管。完成操作及每天工作后都必须对实验室台面清洁和消毒,同样,如有溶液溅出,必须作出记录。

4、扩增产物分析区
本区面积应为6~8m2,扩增产物的分析在本区进行,但使用扩增的产物分析同时完成的荧光定量 PCR 方法或全自动扩增检测分析仪如Roche Amplicor,则本区为需要。产物分析方法一般为板上杂交膜上杂交(ELISA),限制性片段长度多态性分析(RFLP)等。本区仪器设备设置视检测方法不同而定,如为 PCR-ELISA,则需要①微量加样器若干支(覆盖1~200μL);②酶标仪,洗板机和恒温箱;③专用工作服和工作鞋;④专用办公用品;⑤消耗品,如一次性手套、一次性吸水纸、耐高压处理的离心管和加样器吸头(带滤芯);⑥可移动的紫外灯(近工作台面)。
注意事项  本区是扩增产物遗留污染的主要来源,禁止从本区再进入任何“上游”区域。使用 ELISA 方法测定产物,洗板时严禁甩板,应使用洗板机。用过的加样器吸头必须放入专门的消毒(例如含次氯酸钠溶液)容器内,实验桌椅表面每次工作后都要清洁,实验材料如出现外溅则必须作出记录。


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