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中药研究与SCI的完美“邂逅”(二)

2020.5.27

三、机理(药靶)  这一步就是说明药物为啥有功能表型。其实就是找受药物调控的疾病功能基因。

在疾病研究中,我们希望找到的疾病功能基因,是在正常组中低,疾病组中高。也就是说,由于这个基因的高表达导致了疾病的发生发展。这样的基因作为药靶的成功率高些。

在中药研究中,我们希望药靶的表现是,正常组低,疾病组高,疾病治疗组低。季博把这类基因叫做“山“字形基因。三组的表达差异呈现”山“字形。

在正常组,疾病组,疾病治疗组中的“山“字形基因。季博分成3类。

1 、1 类。为已知疾病相关的信号通路基因。 
这类基因其实是现在中药发SCI最多的一类。分值不高。

2 、2 类。为已知疾病相关的重要疾病基因。 
如果做这类基因,分值就高些了。“p53是抑癌基因吗-转录调控-甲基化乙酰化-药靶“这篇文章中的nature文章,所做药靶季博归为2类。季博日志中凡是标题带有”药靶“的文章,希望大家都看看。如果在自己做的筛选过程的,”山“字形基因中有这些基因在。那么就做这些基因去。因为季博分享的文章都是nature。且基本上是今年的。把这些基因作为自己研究药物的药靶,是非常新的。

3 、3 类。未知的疾病相关基因。 
其实,在季博帮人设计课题的时候,如果是着急拿国自然发SCI,那么就做做1类2类的药靶。但其实3类药靶是最好的。因为创新性是最高的。药靶是新发现的,药物跟药靶的关系也是新发现的。

OK。不管是1类2类还是3类药靶,都需要在研究中进行药靶鉴定。药靶鉴定,其实就是我们的疾病功能基因研究的三大块,再加上“药靶与药物的相关性“。

疾病功能基因研究的三大块,临床相关性,功能,机制。这部分大家想了解的话,看下“课题设计思路“。

药靶与药物的相关性。其实与我们做疾病功能基因机制时,阐明A基因与B机制间的关系,其实是一样的思路。把A基因换成我们的药物。

1 、分子相关性 
加药后,药靶的改变。

2 、功能相关性 
a 加药后,药靶下降,细胞有功能表型。那么单独把药靶干扰,看功能表型是否与加药一致。其实,这里的药靶如果是1类和2类,这个实验别人是已经做过的。我们需要重复下。

b 加药后,药靶下降,细胞有功能表型。那么在加药的前提下,把药靶做过表达,看细胞表型是否回复。这个步骤,其实是很多nature上会做的。以证明,药物的功能确实是通过该靶点。这就是rescue实验。

3 、直接互作 
这里跟大家说声抱歉。我们说到现在的药靶,是药物的起效药靶。是否为直接的结合靶点,不一定。药物跟药靶间要做到直接互作的话,药物需要是单体。从单体找可结合的蛋白。且该蛋白为疾病功能基因。如果能够做出来,直接投nature medicine吧。
 
大道至简。在疾病功能基因研究中,总结一句话就是“A基因通过调控B信号通路影响C疾病的D功能“。创新性放A基因上,也就是A基因与疾病的关系是首次报道。

对于中药研究。总结一句话就是“药物E通过调控A基因影响B信号通路抑制C疾病的发生发展“。创新性放什么地方呢。

1 、药物E 与疾病的关系是已知的。 
这种情况适合科研刚起步的筒子们。因为药物与疾病关系是已知的,也就是评估有效性中的动物模型或细胞模型是已知的。那么我们只需要寻找药靶就可以了。

a A基因与疾病的关系是已知的。
这种情况下,药物E与疾病是已知的。A基因与疾病关系是已知的。创新性在于药物E与A基因的关系是首次报道。可以发SCI,但创新性小,分值不高。除非,药物是单体,该单体与A基因直接结合。

b A基因与疾病的关系是未知的。
这个是季博建议的方向。因为单A基因与疾病的关系,证明好了,就是很好的课题。如果按照“课题设计思路“中的去做,做好了10分以上也没问题。这个就属于疾病功能基因研究。在此基础上把药物的工作加进来。创新性是有保障的。其实,不少中药中标的国自然,就是做的这个地方。

2 、药物E 与疾病的关系是未知的。 
这种情况,需要先化大精力在疾病模型和有效性评估上。

因为药物E与疾病关系是新的。那么A基因如果是老的话,故事容易被人理解。如果也是新的,创新性好,不过需要好好设计课题来证明清楚。

这里,季博给大家说个事情。有个老师,按照中标标书的课题,设计完,能够发表SCI文章的前提下。季博提出再找找新的药物。

中药有个说法为“扶正祛邪“。扶正为养。驱邪为毒。这位老师是做肿瘤的。模型啥的都容易搞定。药物上,季博建议到中药中找驱邪的药物。这类药物,对于在肿瘤上来做研究的话,细胞和动物模型上容易操作。这两天看到微信上,张亭栋老先生拿到”求是“奖。Arsenic trioxide ,就是中药中属驱邪,毒的类型。还有就是雷公藤。大家找找吧。

做中药的筒子们,如果想找人讨论课题,可以找季博。因为我们想让您的科研更专业,更简单。同时,季博也希望,大家把中医中药传承好。

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