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DNA重组技术(Recombinant DNA)实验原理、用品和步骤(一)

2020.9.08

【实验原理】
1.DNA重组技术
重组DNA(Recombinant DNA)技术是遗传工程的核心技术,也是人类在基因和DNA分子水平进行操作的技术。它包括以下几个步骤:

1)重组DNA分子的构建:即将目的基因(DNA或cDNA片段)与载体DNA重组,应用TA克隆方法,将PCR扩增产物快速克隆至质粒载体中。该方法利用了PCR过程中使用的热稳定聚合酶(Taq酶)在所复制的双链分子末端加上单一脱氧腺苷酸(A),从而产生一A-粘性末端的性质,设计一种线性载体,使之含有一T-粘性末端,可直接插入PCR产物,在DNA连接酶作用下,目的DNA和载体DNA连接形成重组DNA分子。

2)将重组DNA分子转化宿主细胞。

3)克隆选择增殖:将转化后的液体涂布于琼脂培养基表面,培养基中含有宿主菌敏感的抗生素,重组DNA(TA克隆载体分子)含有相应抗生素的抗性基因,转化的细菌能在培养基上生长形成集落。挑取菌落,置液体培养基中培养,得到大量含重组DNA的细菌。

4)收获扩增后的培养细胞,提取重组DNA分子(质粒),并纯化,获得某一基因或DNA片段的大量拷贝。
2.质粒DNA的小量制备
常见的质粒DNA提取方法有简易一步提取法、碱裂解法和煮沸法。本实验采用的是碱裂解法,碱裂解法的原理:在PH 12.0~12.6碱性环境中,线性的大分子量细菌染色体DNA变性,而共价闭环质粒(CC)DNA仍为自然状态。将pH调至中性并有高盐浓度存在的条件下,染色体DNA之间交联形成不溶性网状结构。大部分染色体DNA和蛋白质在去污剂SDS的作用下形成沉淀,而质粒DNA仍为可溶状态。通过离心,将可去除大部分细胞碎片、染色体DNA、RNA及蛋白质,质粒DNA尚在上清中,再用乙醇沉淀回收质粒DNA。
3.质粒DNA的限制性内切核酸酶(限制酶)切分析
限制酶存在于原核生物体内,根据其结构和功能特性分为:Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ型。Ⅰ型切点不固定,Ⅲ型其切割位点在识别位点之外,只有Ⅱ型其特异性切点位置可以控制和预测,可以产生固定的DNA片段,基因工程中所用的限制酶均为Ⅱ型限制酶。这类酶的特点是具有能够识别双链DNA分子上的特异性核苷酸序列的能力,能在这个特异性核苷酸序列内切断DNA双链,形成一定长度和顺序的DNA片段。选择合适的限制酶对重组的环状质粒进行酶切,将酶切产物进行琼脂糖凝胶电泳检测,用已知相对分子量的线状DNA(DNA分子量标志)及未经酶切的重组环状质粒为对照,可以对重组环状质粒中的目的DNA分子进行初步鉴定。
【实验用品】
1.PCR扩增仪;恒温振荡培养箱;超净工作台;细菌恒温培养箱;台式高速离心机;电热恒温水浴箱;冰箱;电泳仪; 电泳槽,样品槽模板(梳子);紫外灯;保鲜膜;一次性塑料手套;凝胶自动成像仪。
2.三角烧瓶(500ml, 250ml,100ml),培养皿,玻璃试管,试管塞,玻璃棒,酒精灯,镊子,脱脂棉,纱布,乙醇,容器盒。
3.微量加样器(1000μl,200μl,20μl);Tip头(1000μl,200μl,20μl)。Tip头盒(1000μl,200μl,20μl);Eppendorff管(2ml,1.5ml,0.5ml),Eppendorff管架。Parafilm,透明胶带。
4.DNA重组相关试剂:
1)Taq DNA聚合酶,缓冲液,dNTP,特异性引物,靶DNA;凝胶回收试剂盒;TA克隆载体:pMD18-T;感受态细菌;氨苄青霉素(100mg/ml)。
2) LB培养基:胰蛋白胨10g,酵母提取物5g,氯化钠 10g,10N NaOH调pH至7.0定容至1L。15磅高压消毒,4℃保存。
3)LB琼脂培养基:15g琼脂粉溶于1000ml LB培养基,15磅高压消毒备用。
5.质粒提取试剂:
溶液Ⅰ(10×):0.5M葡萄糖;0.25M Tris-Cl (pH8.0);0.1M EDTA,10磅高压消毒,4℃保存备用.
溶液Ⅱ:0.2N NaOH;1%SDS 室温贮存,即用即配。
溶液Ⅲ:3M NaOAc(pH4.8) 10磅高压消毒,室温贮存。
RNA酶 A: 10mg/ml
TE缓冲液:10mM Tris-Cl (pH7.6),1mM EDTA(pH8.0)
6.质粒DNA的限制性内切酶酶切及琼脂糖凝胶电泳相关试剂:
限制性内切酶Hind Ⅲ、XbalⅠ及酶反应所需缓冲液;琼脂糖;溴化乙啶贮存液(10mg/ml);6×载样缓冲液。
Tris-乙酸(TAE)贮存液:
50×:242克Tris碱,57.1ml冰乙酸,100ml 0.5mol/L EDTA(pH8.0)
加水至1L


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