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植物组织制备基因组DNA实验——氯化铯法

2019.3.26

利用基因组DNA较长的特性,可以将其与细胞器或质粒等小分子DNA分离。在提取过程中,染色体会发生机械断裂,产生大小不同的片段,因此分离基因组DNA时应尽量在温和的条件下操作,如尽量减少酚/氯仿抽提、混匀过程要轻缓, 以保证得到较长的DNA。


实验方法原理加入一定量的异丙醇或乙醇,基因组的大分子DNA即沉淀形成纤维状絮团飘浮其中, 可用玻棒将其取出,而小分子DNA则只形成颗粒状沉淀附于壁上及底部, 从而达到提取的目的。
实验材料

植物组织

试剂、试剂盒

抽提缓冲液十二烷基肌氨酸钠TE异丙醇溴化乙锭氯化铯

仪器、耗材

离心机

实验步骤

1.  收取10~50 g 新鲜的植物组织。

 

2.  植物组织用冷的无菌水洗涤、吸干,放人液氮中冻结,用研钵和研杵研成细粉。

3.  将冻结的细粉放入250 ml 的离心瓶中,立即加入抽提缓冲液约每克植物5~10 ml,轻轻搅拌混匀。

4.  加入十二烷基肌氨酸钠使终浓度达1%,于温育1~2 h。

 

5.  用JA-14转子4℃,5 500 g 离心10min 保留上清,必要时重复此歩骤以除去残渣。

6.  加人0.6体积异丙醇,混合,如果看不见沉淀,于-20℃放置30 min,用JA-14转子4℃,7 500 g 离心15 min,弃上清。

7.  沉淀用9 ml TE缓冲液重悬,加入9.7 g 固体氯化铯,混匀,冰上放置30 min,用JA-14转子,7 500 g 离心10 min,保留上清。

 

8.  加入0.5 ml 10 mg/ml 的溴化乙锭,冰上放置30 min,4℃ 7500 g  离心10min.

9.  将上清转入两个5 ml 的快封超离心管中,并封口。

10.  用VTi80转子20℃ 525 000 g 离心4 h,或20℃,300 000 g 离心过夜,用15号针头和注射器收集带。

11.  用氯化艳饱和的异丙醇重复抽提DNA以除去溴化乙锭。

 

12.  加入2体积水和6体积100%乙醇,混匀,-20℃放置1 h,用JA-20或JA-21转子4℃,7500 g 离心10 min。

 

13.  沉淀用TE缓冲液重悬,加入1/10体积的3 mol/l 乙酸钠和2体积的100%乙酵重悬,重复离心。

14.  沉淀晾干后用TE缓冲液重悬。


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