出色灵敏度提升复杂基质中目标肽段定量能力(二)
高效液相色谱分离
高效液相色谱仪: Thermo Scientific EASY-nLC 1000
预柱:Dionex PepMap C18 色谱柱(2cm, ID75μm, 3μm)
分析柱:Dionex PepMap C18 色谱柱(15cm, ID75μm, 3μm)
流动相:A,含0.1% 甲酸的水溶液;B,含0.1% 甲酸的乙腈溶液
梯度: 2%-5% B 2 min,2%-45% B 42min,45%-90% B 3 min,90%B 3min
流速:300 nL/min
上样量: 2 μL
质谱分析
质谱仪:Thermo Scientific TSQ Quantiva
离子源:NanoFlex 离子源
离子模式:正离子
喷雾电压:2.0 KV
毛细管温度:275 ℃
Q1 and Q3 resolution: 0.7 Da;
Cycle time:2s
碰撞能量:通过公式CE=0.034 × 母离子的m/z + 5.314 计算得到相应肽段的碰撞能量,并在此基础上CE加减2 进行进一步优化,选择最优碰撞能量。
实验结果
本实验采用全新一代三重四极杆质谱TSQ Quantiva 对复杂基质中15
条重标肽段进行定量分析,均可获得良好的色谱峰形和质谱响应(图3)。以肽段SSAAPPPPPR*
为例,检出限为(LOD)1amol,定量下限(LLOQ)为5amol(图4)。如图5 标准曲线所示,在5amol-100fmol
五个数量级浓度范围内,浓度与峰面积的线性相关系数在0.99 以上,同时,在amol 级水平仍可获得良好重复性(图6)。15
条肽段的标准曲线和线性范围参见表2。
图3. 15 条肽段总离子流图(TIC)(上样量100fmol)
图4. 肽段SSAAPPPPPR* 不同上样量提取离子流图(EIC)m/z493.8-> m/z 335.7
图5. 肽段SSAAPPPPPR* 标准曲线
图6. 肽段SSAAPPPPPR* 在amol 水平重复性
表2. 15 条肽段标曲和线性范围
结论
实验表明,得益于主动离子管控技术(AIM),TSQ Quantiva在复杂基质中针对目标肽段的定量灵敏度表现突出,极大地提升了TSQ 质谱平台定量复杂基质中目标肽段的能力,适用于复杂生物学样本中低丰度蛋白质的分析,可用于潜在生物标志物的确证工作。
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