黄粉甲触角转录组测序及嗅觉基因鉴定在鞘翅目嗅觉基...
黄粉甲触角转录组测序及嗅觉基因鉴定在鞘翅目嗅觉基因功能研究中的应用
最新一期《Comparative Biochemistry and Physiology Part D: Genomics and Proteomics》（SCI收录，IF=2.823）杂志报导了安徽农业大学植保学院的研究人员在昆虫转录组测序方面的研究论文，该课题组利用第二代高通量测序技术对黄粉甲触角组织进行转录组测序，并鉴定出数十条编码嗅觉蛋白的基因。安徽农业大学植保学院的刘苏博士和李世广博士分别是本文的第一作者和通讯作者。
背景介绍
昆虫灵敏的嗅觉在其生存与繁衍中扮演重要角色。与高等脊椎动物不同，昆虫的嗅觉系统较为复杂，有多个嗅觉蛋白家族参与其中，如气味结合蛋白OBPs、化学感受蛋白CSPs、气味受体ORs、离子型受体IRs、感觉神经元膜蛋白SNMPs等。目前，针对昆虫嗅觉蛋白编码基因的研究，多集中于鳞翅目昆虫，而针对鞘翅目昆虫的研究较少。
结果分析
该课题组使用Illumina HiSeq2000测序平台对黄粉甲（Tenebrio molitor，一种鞘翅目昆虫）进行转录组测序，使用CLC Genome Workbench软件（版本6.0.4）进行序列拼接。转录组测序获得了52,216,616条clean reads，拼接获得了35,363条unigenes。这些unigenes平均长度451 bp，N50值为505 bp。其中18,820条unigenes与NCBI nr蛋白质数据库中已注释的蛋白能够较好地匹配（E-value<10-5）。Gene ontology（GO）和Cluster of Orthologous Groups（COG）也被用于分析这些基因的潜在功能。在35,363条unigenes中，有13,010条（36.79%）能够匹配上至少一个GO的分子功能，而能够匹配上至少一个COG功能的unigenes为11,544条（32.64%）。在黄粉甲触角转录组中鉴定出了19个OBP基因，12个CSP基因，20个OR基因，6个IR基因，2个SNMP基因。本研究是首次对黄粉甲触角进行转录组学研究。上述研究成果为深入研究鞘翅目嗅觉基因的功能奠定了坚实的基础。本课题中的转录组测序与分析服务由上海伯豪生物技术有限公司提供。
原文出处：Liu S, Rao XJ, Li MY, Feng MF, He MZ, Li SG. Identification of candidate chemosensory genes in the antennal transcriptome of Tenebrio molitor (Coleoptera: Tenebrionidae). Comp. Biochem. Physiol. D 2015, 13: 44-51.
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项目成果
