TRIzol法同时提取RNA、DNA、蛋白质-4
注意事项:
1. DNA在中间层和有机相中时可在2~8℃保存过夜。
2.DNA沉淀在75%乙醇中2~8℃可保存几个月。
3.DNA在8mM NaOH溶液中4℃可放置过夜,如长期保存需用HEPES调节pH至7~8并且加EDTA至1mM,可置于4℃或-20℃长期保存。
常见问题分析:
得率低:
A.样品匀浆和裂解的不彻底。
B.最终得到的DNA沉淀没有完全溶解。
A260/A280<1.70 :
A. 检测吸光度时,RNA样品没有溶于水,而溶于了TE中。
B.酚除去的不彻底,可用0.1M柠檬酸钠(含10%乙醇)再洗一遍DNA沉淀。
DNA降解:
A.组织取出后没有马上处理或冷冻。
B.待提取RNA的样品没有保存于-60至-70℃,而保存在了-5至-20℃。
C.样品匀浆时使用了高速匀浆仪。
RNA污染:
A.氯仿分层后水相去除的不干净。
B.DNA沉淀用0.1M柠檬酸钠(含10%乙醇)洗的不彻底。
蛋白质的提取
准备试剂:异丙醇含0.3M盐酸胍的95%乙醇无水乙醇1%SDS。
操作步骤:
1.取沉淀DNA后剩余的上清,用异丙醇沉淀蛋白质。每使用1ml TRIzol加1.5ml异丙醇,室温放置10分钟,2~8℃12000×g离心10分钟弃上清。
2.用含0.3M盐酸胍的95%乙醇洗涤蛋白质沉淀。每使用1mlTRIzol加2ml洗涤液,室温放置20分钟,2~8℃7500×g离心5分钟,弃上清,重复两次。用2ml无水乙醇同样方法再洗一次。
3.真空抽干蛋白质沉淀5~10分钟,用1%SDS溶解蛋白质,反复吸打,50℃温浴使其完全溶解,不溶物2~8℃10000×g离心10分钟除去。分离得到的蛋白质样品可用于Western Blot或-5至-20℃保存备用。
注意事项:
1.蛋白质沉淀可保存在含0.3M盐酸胍的95%乙醇或无水乙醇中2~8℃一个月以上或-5至-20℃一年以上。
2.用0.1% SDS在2~8℃透析三次,10000×g离心10分钟取上清即可用于Western Blot。
常见问题分析:
得率低:
A.样品裂解或匀浆处理不彻底。
B.最后得到的蛋白质沉淀未完全溶解。
蛋白质降解:组织取出后没有马上处理或冷冻。
电泳时条带变形:蛋白质沉淀洗涤不充分。