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circRNA机制研究汇总(二)

2020.4.14

结合蛋白:
(2)CircNfix与Ybx1结合并促进其降解:circNfix和对照组的蛋白质谱分析(A)。采用Ybx1、Nedd4l或阴性IgG抗体进行RIP实验(云序生物提供该服务)(B)。P0 CMs中过表达circNfix后Ybx1蛋白表达水平(C-D)。qRT-PCR检测P0 CMs中Ybx1 mRNA表达水平(E)。RNA FISH在P0 CMs中过表达和不表达circNfix时, circNfix和Ybx1的亚细胞共定位(F)。分馏实验表明,circNfix过表达促进了Ybx1在细胞质中的易位,增加了Ybx1在细胞质中的降解(G)。在circNfix和Ybx1干扰后,细胞周期蛋白A2和细胞周期蛋白B1的表达水平(H)。ChIP-qPCR(云序生物提供该服务)检测显示,cyclin A2和cyclin B1启动子中Ybx1结合位点扩增(I)。细胞裂解物用抗Ybx1抗体免疫沉淀,用泛素(Ub)特异性抗体、抗Ybx1抗体或抗nedd4l抗体免疫印迹分析进行WB分析。过表达circNfix的CMs中Ybx1蛋白表达水平(K-L)。

ceRNA机制:
(3)circNfix与miR-214的相互作用:预测miR-214和miR-761能够与circNfix结合(A)。成年小鼠心脏中下调circNfix后,miR-214和miR-761的表达(B)。双荧光报告实验检测miR-214和circNfix能够直接结合(C)。RNA pull-down(云序生物提供该服务)实验检测circNfix能够拉下miR-214(D)。RNA FISH实验检测P0 CMs中,miR-124和circNfix能够共定位在胞质中(E)。RNA FISH实验检测P0 CMs中,miR-124和Gsk3β能够共定位在胞质中(F)。双荧光报告实验检测miR-214和Gsk3β 3’UTR直接结合(G)。WB检测干扰circNfix后Gsk3β蛋白的表达水平(H)。WB检测干扰或过表达miR-124后Gsk3β蛋白的表达水平(I)。WB检测干扰circNfix和miR-214后Gsk3β蛋白的表达水平(J)。CMs中,干扰circNfix后β-catenin的表达水平(K)。CMs中,干扰Meis1后Meis1和 Gsk3β的表达水平(L)。CMs中,干扰Meis1和circNfix后GSK3β的表达水平(M)。干扰circNfix, Ybx1, miR-214 和 Gsk3β后,P7 CMs进行pH3 和 Aurora B免疫染色(N)。

总结

circNfix如何通过与Ybx1和miR-214结合来调控心脏再生过程:转录因子Meis1与circNfix的SE结合后,抑剂circNfix的表达,缺失的circNfix能够增强Ybx1与Nedd4l (E3泛素连接酶)的相互作用,并诱导Ybx1发生泛素化降解,并进一步抑制下游cyclin-A2和cyclin-B1的表达。同时,缺失的circNfix能够,降低对miR-214的吸附,进一步抑制Gsk3β及VEGF的表达,最终促进心肌梗死后心脏再生修复和功能恢复。



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