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超速区带转头的二次病毒纯化

2020.7.14

设备:日立CP-70MX或CP-70ME超速离心机

P35ZT区带转头,RPZ-S密封加样器,Master-flex 软管泵(流量100—1000ml/分)

样品:用鸡胚培养后收集的尿囊液,予冷至4℃左右(流感病毒,仙台病毒或其他)

 

予处理:

1.       已培养好的鸡胚(蛋)用75%酒精消毒;

2.       人工或机械(自动)收集鸡胚尿囊液,按鸡蛋大小收集量略有不同(每只6-8ml);

3.       初滤:10μm滤芯过滤;

4.       连续流离心或超滤系统过滤;

A.     连续流离心:日立R13C连续流转头,12,000rpm,流速600-800ml/分,上清液用于透析浓缩

B.      Millipore超滤系统:0.45μm滤膜

5.       透析浓缩:用Millipore超滤器,1000KD膜包。

浓缩后通常为尿囊液的1/30-1/40

浓缩后液体用于超速离心分离纯化。

 

区带转头离心分离:

 

第一组分离:

Ⅰ. 转头低速旋转:2000rpm—3000rpm,4℃,予冷(转头也可以在冰箱中予冷过夜)

Ⅱ. 从转头外壁依次注入:65ml PBS(磷酸缓冲液),1000ml予处理后的尿囊液(予冷4℃),130ml 30%(w/w)蔗糖液,然后用55%(w/w)蔗糖液充满转头(约450ml—500ml)(蔗糖液配置后放在4℃冰箱中予冷待用)

Ⅲ. 拆除加样头,装上密封盖

Ⅳ. 关闭离心盖板,抽真空,转头加速到32,000rpm(100,000xg),4℃,150分钟

Ⅴ. 超速离心完成后转速下降至(2000—3000)rpm,中心孔管道接到分光光度计的标准流动池。流动池出口接分部收集器。

Ⅵ. 用60%(w/w)的蔗糖从转头外侧泵入区带转头,从中心孔依次排出第一次离心后的各个组份

Ⅶ. 排出的液体直接输入到分光计或蛋白核酸分析仪的标准流动池并连续测定O.D.值,测定后收集。

Ⅶ. 病毒沉降在30%与55%蔗糖梯度之间的某个界面附近,分光计用280nm波长检测O.D.值,在分光光度计的显示屏上或打印机上绘出转头的容量—O.D.值曲线。在高、低密度蔗糖梯度液之间有一个病毒峰。30%--55%蔗糖在离心后由于浓度扩散在原界面附近已形成了一个连续的密度梯度。【可以在分部收集后(约50管)用阿贝折射仪(4℃恒温)测定每管的光折射率并对照查出4℃时的蔗糖密度,绘出蔗糖密度曲线】,而O.D.曲线峰顶的位置对应着某个蔗糖的密度。

Ⅷ. 根据峰的位置认定病毒所在离心管

Ⅸ. 留取约150ml病毒液4—5℃储存待用

Ⅹ. 重复(Ⅰ—Ⅷ)的过程再做二次病毒的分离和收集,三次离心共收集粗制病毒液500--550ml,4℃-- 5℃保存待用

 

第二组离心:

Ⅰ. 将第一组三次离心后收集的粗制病毒液配置成20%(或25%)低密度蔗糖液(w/w)

Ⅱ. 第一组离心后的区带转头停转后倒出浓(60%w/w)蔗糖(可以重复使用),清洁后,再安装到离心机上低速旋转(4℃)予冷

Ⅲ. 从转头外侧依次泵入:130ml PBS,550ml在(20%或25%)蔗糖中的病毒粗制液,600ml 30%蔗糖液,约410—420ml  55%(w/w)蔗糖液(以上液体均予冷到4℃左右再泵入)

Ⅳ. 加样完毕后卸下加样器,装上密封盖,关门,抽真空,转头加速到32,000rpm(约100,000xg),240分钟,4℃

Ⅴ. 重复第一组(Ⅳ—Ⅵ)步骤,分步收集成50管,经250nm,O.D.值连续测定,可以看出在比第一组峰顶相对应的蔗糖梯度略高的位置形成很尖锐的病毒峰。可以收取约120ml高纯度的病毒液

Ⅵ. 最终的蔗糖密度梯度分布呈现连续的有近似台阶形状的密度分布。O.D. 峰位于离心前30%与55%(w/w)界面稍靠外位置

 

讨论:

Ⅰ.也可以用PBS来配置不同密度蔗糖液

Ⅱ. 用阿贝折射仪测蔗糖密度时样品温度应保持在4℃

Ⅲ. 由于转头和加样系统结构的差异,使用Beckman Ti—15转头(32,000rpm,102,000xg)时,泵入高密度蔗糖(55%w/w)和用60%(w/w)蔗糖液泵出时进出样的速度必须很慢,否则很容易产生内漏(即已分离好的样品和高浓度蔗糖混合而使离心失败)。使用日立P35ZT区带转头(35,000rpm,122,000xg)和Beckman Ti—15区带转头时要特别注意主机和加样系统的水平调整和离心后转动部件的清洗与润滑,这些操作对防止漏液、延长转动摩擦密封的寿命(熟练的操作者可以使一个密封器工作150次或更多,不熟练的随意操作可能使昂贵的摩擦密封只能工作15—20次)非常重要

Ⅳ. 以上介绍的离心方法也适用于超速连续流转头分离(Hitachi P32CT系统,Beckman CF—32Ti系统,Sorvall TCF—32系统—Sorvall采用Hitachi OEM的Discovery SE或Ultra-WX系列超速离心机),稍有区别的是在加速到分离转速后(一般为28,000rpm—32,000rpm)先排出近转头中心的PBS液再以每小时0.8—1.5升的速度连续泵入尿囊液或组织培养液。每次离心可处理(4—6)升样品。根据第一组分离的结果(病毒的纯度和含量)决定是否进行第二组分离。

Ⅴ. 如果需要处理的样品量达到20升/24小时或更多时,可考虑使用日立大容量超速连续流系统CC-40(40,000rpm,118,000xg,最大流量50升/小时,病毒纯化常用流量8升/小时—12升/小时)或CC-40S,应用的蔗糖梯度、缓冲液及分离程序与一般超速连续流相似。从操作者的角度比较,以上三种设备:CC—40自动化程度最高,操作简易;区带次之;一般超速连续流系统对操作者要求较高

Ⅵ. 较低密度蔗糖液的用量和每次处理的样品量及样品的病毒浓度有关。处理样品量大,病毒浓度低,则30%(w/w)蔗糖量较少,反之则应增加用量

Ⅶ. 制备区带梯度和加样的进液速度约为50ml—200ml/分,出样速度为100ml/分左右,某些机型的进出样速度可能要降低到20—50ml/分。

 


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