打破垄断，推陈出新！华大基因推出超强基因测序仪T7
最近,华大发布其自主研发的最新超高通量基因测序仪——“MGISEQ-T7”。华大方面表示,基于华大多年来在核心技术上的自主研发与突破,目前的T7是全球日生产能力最强的基因测序仪,堪称“超级生命计算机”。据了解,基因测序仪是基因测序产业的上游核心,也是基因测序产业链上壁垒最高的部分。测序设备依赖进口一直是我国基因测序产业发展的瓶颈,无论是科研还是临床应用,都要求测序设备国产化的进程加速,实现更大的突破。正是看到测序仪与测序技术的重要性,以华大为首的国内基因测序企业在国产测序仪研发、生产方面作出了不懈努力。2015年至2017年,华大相继推出了拥有完全自主知识产权、具有国际先进水平的桌面型测序仪BGISEQ-500和BGISEQ-50、MGISEQ-2000、MGISEQ-200,不断打破基因测序产业链上技术壁垒,从技术上首先突破欧美企业的垄断。
图1:华大发布其自主研发的最新超高通量基因测序仪——“MGISEQ-T7”
那么,这台堪称“超级生命计算机”国产测序仪T7,究竟有多厉害,是否已完全赶超了其他同类产品?对行业的发展有什么作用?
全球首创4联芯片+行业最快速度 T7日产数据最高达6Tb
MGISEQ-T7凭借快速、灵活、超高通量的技术特点,可全面提升测序日生产能力。
速度方面,MGISEQ-T7仅需不到24小时即可完成双端150bp测序(PE150),比现在市面上速度最快的同类测序仪速度提升了50%以上,图像数据处理速度提升了15倍,最大限度节省用户的时间。
利用全球首创的4联芯片平台,4张芯片的测序过程完全独立,互不影响,多种读长随时上机,24小时不间断运行,用户可根据自己的测序需求,随时随地开展不同应用的测序。
MGISEQ-T7作为目前全球日生产数据量最高的测序仪,每天可产出数据量高达6T,也就是一台T7测序仪每天可完成60人的全基因组测序,半年即可完成万人基因组计划。
图2:“MGISEQ-T7”
与其他同类产品相比,T7有何竞争优势?
从公布的数据来看,相比于此前发布的自主研发测序仪,MGISEQ-T7的超高通量已经优于Illumina在2017年发布的NovaSeq 6000。
NovaSeq 6000产出6T数据量用时40小时,每次运行最多可测序48个人类基因组。MGISEQ-T7产出6T数据量用时24小时,1台T7测序仪每天可完成60人的全基因组测序。速度的提升意味着成本的降低,MGISEQ-T7的测序成本比以往更接近100美元。
NovaSeq 6000可运行S1、S2、S3和S4四种不同的流动槽,并通过同时运行一个或两个流动槽获得更大的测序通量和产出数据。而MGISEQ-T7拥有全球首创4联芯片平台,4张芯片的测序过程完全独立,多种读长随时上机,互不影响,最大限度的满足用户需求。
应用场景广泛 推动基因测序行业全面发展
此外,值得注意的是,MGISEQ-T7的超高通量使其在应用方面受到的限制较少。华大表示,MGISEQ-T7适用于全基因组测序、超深度外显子组测序、表观基因组测序、肿瘤大Panel等大型测序项目。
从应用场景来看,MGISEQ-T7适合国家级基因组学项目、基因检测服务企业、医学、消费级基因测序公司使用。
T7的超高通量在加速推动国家级项目进程方面有强大的应用潜力。如进行万人基因组项目,1台T7仅需大半年；十万人基因组项目,6台T7仅需1年；除了超高通量的数据产出,MGISEQ-T7快速灵活的运行特点,也能满足企业多种测序需求；MGISEQ-T7提高了运行速度,大大压缩了交付过程中最耗时的测序时间,可以实现3天内快速交付检测结果,恰恰可以满足医学研究的超高时效要求；由于具备快速、成本更低等特点,MGISEQ-T7能够帮助基因测序服务公司加速项目推广,让更多普通消费者认识了解基因测序仪。
从MGISEQ-T7的应用场景不难看出,快速、灵活、高通量的特点有利于加速基因测序项目的完成。无论是基因组学科研的进度,还是商业测序项目的推广,都将提前完成预期目标,有助于推动整个基因测序行业的发展进程。
最后,相信随着我国研发实力的不断提升,将有更多性能优越测序仪等自主研发产品面世,为基因测序与精准医疗产业发展做出贡献,期待华大以首的国内基因测序企业继续创新,不懈努力,打造出更多国之重器,不仅能从技术上打破国际企业垄断之势,更能全面推翻欧美企业在行业中垄断地位。
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