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两种多重数字PCR试剂检测EGFR的活化和耐药位点

2020.4.13

数字PCR应用文献---

两种多重数字PCR试剂检测EGFR的活化和耐药位点


NaicaTMcrystal数字PCR

通常生物学样本量有限,通过单次实验获得足够多的信息对于研究人员和诊断人员至关重要。NaicaTMcrystal数字PCR系统实现了单次实验中同时检测和定量多重生物标志物,并确保数据精准度和可信度,通过3个不同的荧光通道,非常明确地区分靶标位点。这种简单快速的技术平台能够兼容多种荧光染料组合,大大地扩展了实验设计的可能性。

在NSCLC(非小细胞肺癌)治疗中,EGFR(表皮生长因子受体)是种常见的药物作用靶点。EGFR活化突变位点,如L858R,L861Q和19外显子缺失用于预测TKIs(酪氨酸激酶抑制剂)药物药效,同时EGFR T790M突变用于一代TKIs药物耐药预测。
 
为了在不牺牲结果的准确性和可靠性的情况下,在单个测试中检测这些突变的数量,开发了两个多重方法。引物和探针使用NaicaTMcrystal数字PCR系统三种不同荧光通道,在Panel1中可同时检测EGFR L858R、L861Q、T790M和野生型EGFR,在Panel2中可以同时检测19外显子缺失、T790M和野生型EGFR。所有的assays都在400copise/ul野生型DNA 背景下,EGFR突变等位基因的频率分别为0.25%和0.1%(如图)


这两个3色数字PCR检测EGFR试剂盒检测非小细胞肺癌患者跟NGS比较,测得的突变等位基因EGFR片段具有较强的相关性。(如图)


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