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细菌中制备基因组DNA实验——小量制备

2019.3.26

真核生物的一切有核细胞(包括培养细胞)都能用来制备基因组 DNA。真核生物的DNA是以染色体的形式存在于细胞核内,因此,制备DNA的原则是既要将DNA与蛋白质、脂类和糖类等分离,又要保持DNA分子的完整。


实验方法原理提取DNA的一般过程是将分散好的组织细胞在含SDS(十二烷基硫酸钠)和蛋白酶K的溶液中消化分解蛋白质,再用酚和氯仿/异戊醇抽提分离蛋白质,得到的DNA溶液经乙醇沉淀使DNA从溶液中析出。
实验材料

细菌

试剂、试剂盒

TE氯化铯溴化乙锭NaCl乙醇CTAB

仪器、耗材

离心机摇床

实验步骤

1.  培养5 ml 的细菌培养物至饱和状态,取1.5 ml 的培养物离心2 min。

2.  沉淀物加入567 ul 的TE缓冲液,用吸管反复吹打使之重悬。

3.  加入30 ul 10%的SDS和3 ℃ 20 mg/ml蛋白酶K,混匀,于37℃温育1 h。

 

4.  加入100 ul 5 mol/l NaCl充分混匀,再加入80 ul CTAB/NaCl溶液,混匀,于65℃温育10 min。

 

5.  加入等体积的氯仿/异戊醇,混匀,离心4~5 min将上清液转人一个新管中,如果难以移出上清,先用牙签除去界面物质。

 

6.  加入等体积的酚/氯仿/异戊醇,混匀,离心5 min,将上清液转入一只新管中。

 

7.  加入0.6体积异丙醇,轻轻混合直到DNA沉淀下来,用一个封口的巴斯德管将沉淀转移至1 ml 的70%乙醇中洗涤。

 

8.  离心5 min,弃上清,用冻干机稍加干燥,重溶于的下100 ul  TE缓冲液,每次酶切反应用10~15 μl。


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