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中山大学杨建华团队发1篇Nature,揭示m6A详细调控机制

2019.3.15

  2019年3月13日,美国希望之城贝克曼研究所陈建军,芝加哥大学何川,中山大学杨建华及辛辛那提儿童医院黄刚共同通讯在Nature在线发表题为“Histone H3 trimethylation at lysine 36 guides m6A RNA modification co-transcriptionally”的研究论文,该研究揭示了Lys36(H3K36me3)的组蛋白H3三甲基化【转录延伸的标记】,指导m6A的沉积过程。

  有趣的是,该研究显示m6A修饰在H3K36me3峰附近富集,并且当细胞H3K36me3耗尽时,m6A在整体上减少。在机制上上,H3K36me3被METTL14直接识别和结合,METTL14是m6A甲基转移酶复合物(MTC)的关键组分,后者又促进m6A MTC与邻近RNA聚合酶II的结合,从而将m6A MTC递送至活跃转录的新生RNA。在小鼠胚胎干细胞中,H3K36me3耗尽也显著降低m6A转录丰度组范围,导致细胞干活性增加。

  总之,该研究揭示了H3K36me3和METTL14在确定mRNA中m6A的特异性和动态沉积中的重要作用,并揭示了涉及组蛋白修饰和RNA甲基化之间交流的另一层基因表达调控。

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  转录组范围的m6A作图揭示了人和小鼠转录组中大约7,000个mRNA中m6A修饰的存在,并揭示了共有基序RRACH(其中R表示G或A; H表示A,C或U),其中A被转化为m6A。 尽管METTL3-METTL14甲基转移酶复合物在体外识别了RRACH基序,但这些基序中只有一部分在体内被甲基化,这种修饰通常发生在编码序列(CDS)和3'-非翻译区(UTR)。 如何选择单个转录物和特定位点以正确沉积m6A修饰仍不清楚。

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H3K36me3组蛋白修饰影响从头m6A RNA甲基化

  该研究报告Lys36(H3K36me3)的组蛋白H3三甲基化【转录延伸的标记】,指导m6A的沉积过程。有趣的是,该研究显示m6A修饰在H3K36me3峰附近富集,并且当细胞H3K36me3耗尽时,m6A在整体上减少。

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H3K36me3和MTC在m6A调节中的转录组互作

  在机制上上,H3K36me3被METTL14直接识别和结合,METTL14是m6A甲基转移酶复合物(MTC)的关键组分,后者又促进m6A MTC与邻近RNA聚合酶II的结合,从而将m6A MTC递送至活跃转录的新生RNA。在小鼠胚胎干细胞中,H3K36me3耗尽也显著降低m6A转录丰度组范围,导致细胞干活性增加。

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H3K36me3被METTL14识别并指导共转录的m6A修饰

  总之,该研究揭示了H3K36me3和METTL14在确定mRNA中m6A的特异性和动态沉积中的重要作用,并揭示了涉及组蛋白修饰和RNA甲基化之间交流的另一层基因表达调控。

  原文链接:

  https://www.nature.com/articles/s41586-019-1016-7


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