SSAM-02：microRNA 表达量与差异表达 该分析模块内容包括：（1）对样本miRNA表达量进行计算，分别考 Ha......
SSAM-03：新microRNA 预测 本分析模块是系统识别不同物种和特定组织，处理条件下的miRNA。对深入认识基因组调控规律和......
SSAM-04：microRNA 靶基因预测 针对候选miRNA（例如差异分析获得的miRNA），采用经典软件算法，如TargetS......
SSAM-05：microRNA-靶基因调控网络分析 本方案分析内容：通过整合microRNA与靶基因之间的调控，microRNA靶......
SSAM-06：pri-microRNA 基因预测 本方案将采用双向BLAST和synteny分析识别保守与非保守的pre-miRN......
SSAM-07：microRNA 核心启动子预测 本方案特点和主要目的将对miRNA基因的核心启动子进行分类，分析不同物种内miRN......
SSAM-08：基于染色质结构识别microRNA 启动子识别 一些研究已经识别了启动子序列上的染色质特征。某些组蛋白修饰主要是甲基......
SSAM-09：microRNA SNP分析 本模块分析目的是针对模式动物的miRNA不同区域的SNP位点和MAF进行统计分析。针对......
SSAM-10：microRNA 进化分析 本方案分析目的是构建指定物种之间miRNA的进行系统进化分析，构建系统发生树；另外对mi......
SSAM-11：piRNA分析 piRNA?PIWI 相互作用的小RNA 功能研究是关于非编码小RNA ......
SSAM-12：microRNA 与多组学数据整合分析 对于复杂性状研究而言，基因功能会受到基因拷贝数copy numbe......
SSAM-01：microRNA 高通量测序数据分析 NGS深度测序所得小RNA短序列（sRNA）中含有miRNA，rRN......
NSAM-09 比较基因组分析-始祖染色体进化 全基因组复制（Whole genomeduplication,WGD）与复......
NSAM-08 比较基因组分析-系统发生分析 生物体的全基因组是由大量的基因以及非编码核酸组成的，所以，从理论上说，研究不同物种进化......
NSAM-07 比较基因组分析-同源基因分析 本方案将讨论物种同源序列以及进化过程中和在特定选择压力下的基因功能与进化问题。同源序列......
NSAM-06 比较基因组分析-同线性分析 通过对不同亲缘关系物种的基因组序列进行比较，能够鉴定出编码序列、非编码调控序列及给定物种......
NSAM-05 基因组注释-转座元件与复重序列 从原核生物到真核生物,其基因组中的重复序列呈递增趋势。重复序列的作用也被各种实验所揭......
NSAM-04：基因组注释-非编码RNA分析 本方案将对一些重要的非编基因进行注释，包括：miRNA、tRNA、snoRNA。针对功......
NSAM-03 基因组注释-编码基因功能注释 该分析模块是对基因组预测编码基因后的基因本体功能分析。主要内容包括（1）通过NCBI&......
NSAM-02 基因组注释-基因预测 基因预测是注释高通测序数据所获得的连续的基因组序列重要分析内容。分析目的是预测完整的转录本可编......
