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RNA 反转录

2020.8.11

 实验材料 poly(A)+RNA反转录酶鼠源反转酶 或禽源反转录酶

试剂、试剂盒 oligo(dT)12-18 lmol LTris-Cl 1mol LTris-Cl lmol LKC1 25 mmol LMgCl2 dNTP 混合物 0.lmol LDTT RNasin

实验步骤

一材料与设备


1)poly(A)+RNA,lmg/ml


Z)oligo(dT)12-18,lmg/ml


3)lmol/LTris-Cl(pH7.6)。


4)1mol/LTris-Cl(pH8.3)


5)lmol/LKC1


6)25 mmol/LMgCl2


7)dNTP 混合物,各 5 mmol/L


8)0.lmol/LDTT


9)RNasin。


10) 反转录酶,鼠源反转酶 (Pharmacia 公司,200U/ul) 或禽源反转录酶(20U/ul)



二、操作方法


(一) 使用鼠源反转录酶合成 cDNA


1) 在灭菌微量离心管中混合下列物质,并置于冰上:


Poly(A)+4RNA,lmg/ml                                          10ul


oligo(dT)12-18,lmg/ml                                          10ul


lmol/LTris-Cl(pH7.6)                                             2.5ul


lmol/LKC1                                                          3.5ul


250 mmol/LMgCl2                                                2ul


dNTP 混合物,各 5 mmol/L                                 10ul


0.lmol/LDTT                                                        2ul


RNasin                                                             25U


鼠源反转录酶                                                    200U


加水至总体积为                                                 50ul


2) 于 37°C 反应 lh


3) 纯化回收. 保存于一 20℃


(二)使用禽源反转录酶合成 cDNA


1) 在火菌微量离心管中混合下列物质,井置于冰上:


poly(A)+RNA,lmg/ml                                             10ul


oligo(dT)12-18,lmg/ml                                           10u1


lmol/LTris-Cl(pH8.3)                                              2.5uI


lmol/LKC1                                                            3.5ul


250 mmol/LMgCI2                                                 2ul


dNTP 混合物,各 3 mmol/L                                   10ul


0.lmol/LDTT                                                          2ul


RNasin                                                                25U


禽源反转斌酶                                                       40U


加水至总体积为                                                    50ul


2) 于 42℃ 反应 lh


3) 纯化冋收,保存于一 20℃


注意事项

1) 可以先进行小规模的预实验以确定反转录酶的用量。


2) 在反应中加入 [α32P]dCTP,可以通过放射性自显影检测反转录的质量和产率


3) 对于具有不利于转录反应的二级结构的 mRNA 的转录,使用最适温度为 42℃ 的禽源反转录酶可能取得较好的结果。


4)除使用 oligo(dt)12-18 外,在反转录反府中也可以使用长度为 6 的随机寡聚核苷酸。


5) 随若基因芯片技术的发展和逐渐普及应用,产生了由 mRNA 反转彔而获得荧光标记 cDNA 探针的方法。与常用的 RNA 探针同位素标记不同之处就在于其加入了荧光染料 Cy3 或 Cy5 代替了冋位素标记的 dNTP。


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