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提取植物rna方法

2020.3.30

  提到RNA的提取,是不是充满了心酸和无奈呀,抽提过程中已十分小心谨慎了,但是有时候还是会出现RNA污染、降解的悲剧。别怕,今天小编给您介绍一种新的RNA提取方法,比以前的方法更快、更有效和更可靠,让您从此不用再担心的RNA的抽提了。

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  众所周知:获得纯净、完整的RNA样品,是对一种植物的活性基因或转录组进行测序所必不可少的。但是存在于植物组织中的化合物(如黄酮类、鞣质、蜡和其他次生代谢产物),使我们很难始终如一地从很多种植物中提取到质量较好的RNA。

  在最近一期的《Applications in Plant Sciences》中,研究人员向我们详细描述了这种新方法。这种最成功的方法:将Trizol试剂和Turbo DNA试剂盒与研究人员检测的附加步骤相结合。

  在一个大型国际转录组测序项目中,研究人员选取了各种木质的、芳香的和水生的植物。他们进行了382次独立的RNA提取实验,在各种各样的植物中检测不同的技术。这种新程序的一个关键成分是常用于洗发剂的相同发泡剂——月桂酰肌氨酸钠(sodium lauroyl sarcosinate),绰号Sarkosyl。自上世纪70年代以来科学家一直都在使用它,因为它能分解细胞脂肪膜,释放细胞的内容物。

  “结合Trizol和Turbo试剂盒,Sarkosyl有助于从大多数植物种类中提取高品质和高数量的RNA。加入CTAB步骤,可提高RNA提取的成功率,即使是最顽固的物种。”另外,RNA是极其脆弱,对RNA酶的降解很敏感,这种酶到处存在于自然中,包括空气中。工作区必须消毒,因为RNA酶可以迅速将完整的RNA链转换成不适合测序的“核酸汤”。

  Jordon-Thaden还提到:“一旦我们收集了植物组织,如剪叶,用于RNA提取,我们就将其快速冷冻在液氮中,以防止降解。然后我们把它磨碎,并将其混入试剂混合物中,随后洗去植物纤维和其他细胞成分。这个过程越长,RNA降解的可能性就越大。”


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