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小鼠β-actin基因的克隆表达(1)

2020.9.08

动物组织RNA的提取
实验目的:掌握由动物组织中提取总RNA的方法

实验原理:Trizol试剂是一个包含酚、异硫氰酸胍和SDS的单相酸性溶液,其在裂解细胞的同时抑制RNase的活性,随后加入氯仿,酚会大量的溶解在氯仿中。由于DNA和RNA在酸性酚中的溶解性不同,造成DNA分布在下层的氯仿酚溶液中,RNA则分布在上层的水相中,最后用异丙醇沉淀水相中的RNA,并用70%乙醇洗涤沉淀,这样就可以得到比较纯净的总RNA.

实验步骤:

① 先在研钵中加入液氮,再将组织剪成小块在液氮中磨成粉末,用液氮预冷的药匙取50~100mg组织粉末加入已盛有1ml的Trizol液的EP管中(注意组织粉末总体积不能超过所用Trizol体积的10%),充分混合均匀。

② 室温放置5min,然后加入200µl的氯仿,盖紧EP管并剧烈摇荡15秒钟。

③ 12000rpm离心10min,取上层水相于一新的EP管中(千万不要将中间的沉淀层和下层液混入,否则重新离心分离),加入500µl异丙醇,温和颠倒混匀。室温放置10min,12000rpm离心10min。

④ 小心地弃去上清液,加入1ml的75%乙醇,涡旋混匀,4℃下12000rpm离心5min。重复操作一次。


⑤ 弃去上清液(尽量将残余液体除去),室温或真空干燥5~10min(注意不要干燥过分,否则会降低RNA的溶解度)。用30µl DEPC处理过的水将RNA溶解,必要时可55℃~60℃水浴 10min。RNA可进行mRNA分离,或贮存于70%乙醇并保存于-70℃。

另外,还可以通过试剂盒提取总RNA, 操作步骤见试剂盒说明。
RT-PCR扩增目的基因及琼脂糖电泳分析
实验目的:掌握通过RT-PCR方法由真核生物的总RNA中获得目的基因的方法,并通过琼脂糖电泳对扩增结果进行定性检测。

实验原理:由于真核生物的mRNA的3′端存在 Poly(A)尾,这样以olig(dT)为引物,在逆转录酶的催化下,就可以合成互补DNA(cDNA),然后以cDNA为模板,利用目的基因扩增引物进行PCR就可以扩增出目的基因。

实验步骤:

RNA的反转录

① 在小EP管中依次加入

RNA模板 3 μl

Olig(dT)18引物 1μL

DEPC H2O 8 μL

混合后,70℃水浴5 min(破坏二级结构),再冰浴5min。
② 在管中依次加入 (反应体系为20 μL):

RT 5×buffer 4μL

RNasin 1μL

dNTP ( 10mM) 2μL

混匀,37℃ 5min。

M-MULV反转录酶 1 μL

置于 42℃水浴,1h。

③ 70℃保温5min(使酶失活)。

④ 于-20℃保存备用。

PCR扩增目的基因

以反转录产物为模板,克隆引物B1,B2为引物,利用rTaq酶进行扩增目的基因,用于后续连入克隆载体的操作,然后再以表达引物EB1,EB2为引物,利用Pfu DNA聚合酶进行扩增目的基因,用于后续连入表达载体的操作。

94 ℃ 3 min


94 ℃ 45Sec

30 cycles: 57 ℃ 45Sec

72 ℃ 45Sec

72 ℃ 5min

扩增结果通过琼脂糖凝胶进行电泳检测
载体和外源DNA的连接反应
实验目的:为了实现DNA的体外重组,选择合适的限制性内切酶,对两者进行酶切,产生粘性末端,利用T4DNA连接酶将基因片段与载体连接起来,体外构建成重组DNA分子。

实验原理:
目的片段与T载体的连接反应
利用Taq酶除了聚合功能外,同时具有的末端连接酶的功能,在每条PCR扩增产物的3`端自动添加一个3`-A突出端,而在线性的T载体的5`端存在一个5`-T突出端,这样在高活力的T4DNA连接酶的作用下,在很短的时间那就能完成连接反应。
目的片段与表达载体的连接反应
已知在载体pGEX 4T-1上存在BamHⅠ和SalⅠ的单一限制性酶切位点,而在扩增目的片段时我们在引物的5`端人为引入BamHⅠ和SalⅠ酶切位点,将它们同时进行双酶切,就可以产生互补的粘性末端。这样在T4DNA连接酶催化下,载体质粒与目的片段的粘性末端共价结合,环化为重组DNA分子。


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