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cDNA链的连接、包装及转染

2020.9.08

一:仪器:同cDNA文库构建技术-cDNA链的反转合成

二:试剂:EcoRⅠ连接子试剂盒

三:操作:

1:cDNA加接头反应

a:按下表准备反应体系

10×缓冲液T4DNA连接酶3μl

BSA 3μl

cDNA 2.5μl

连接子 1μl

T4DNA连接酶 1μl

加水至 30μl

b: 15℃保温6-18小时

c:70℃加热10分钟后放置于冰浴

2:磷酸化反应

a:按下表准备反应体系

上述1.a反应物 30μl

T4磷酸激酶10×缓冲液 4μl

0.1mM ATP 2μl

T4激酶(10μ/μl) 1μl

水 3μl

总体积 40μl

b:37℃保温30分钟。用DNA纯化柱纯化带接头的cDNA

c: 用1ml Sephacryl S-400装柱,TEN缓冲液平衡拄,平衡液流干后,加套管,800g5min

d: 上样,用1mlTEN缓冲液洗柱2次,收集洗脱液。洗脱时加套管,800g5min

e:合并洗脱液.

D:3M NaAC和无水乙醇沉淀,干燥复溶
3:cDNA与载体联接:

a:准备4个离心管,按下表加入

A B C D

载体DNA0.5ug/ul) 2

cDNA(10ng/ul) 0 32 1

10×T4DNA连接酶缓冲液 1

水 6 3 4 5

T4DNA连接酶 1

b:保温,室温:3小时;4℃过夜

4:体外包装:

a:从-70℃取出包装蛋白,冰浴中溶化,每管50ul

b:包装蛋白混合液完全溶化后,立即加入10ul“3.a”中的连接液,轻弹管壁,轻轻混匀。

c:22℃(室温)放置3小时

d:上述包装混合液中加入445ul的phage缓冲液和25ul氯仿,轻轻混匀,冰浴保存。(包装液4℃下可存放7天)

5:感染

a:灭菌培养皿中倒入下层LB培养基,凝固后,37℃保温

b;安1:1000的比例稀释“4”中的包装混合液。

c:取100ul稀释液和100ul菌株(Y1090、LE392)

d:取4ml熔化45℃保温的上层培养基加入到“c”中的混合液中,混匀后铺板在37℃预热的下层培养基上,37℃过夜。

6:收集和扩增文库

构建的cDNA文库经扩增后,才能保存和进行长期筛选。本文库由λgt11作为载体而构成,因此扩增时应在大肠杆菌Y1090中进行。

a:在过夜后的培养皿上挑取出现的噬菌斑,加2-3mlSM缓冲液,室温震荡2小时。4℃7000g离心30min,以除去细胞碎片,分装上清,溶解噬菌斑,4℃8000-10000g快速离心10min,以除去细胞碎片和培养基成分。

b:重复上步操作

c:上清液转入一新管 中,如要在4℃短期保存则按1ml上清中加入20-30μl的比例加入氯仿,4℃保存;如要长期保存则应加入终浓度为7%的二甲基亚砜,于-70℃保存。以被需要时重新涂板筛选文库。。

总结:C文库构建的简单流程为: RNA-mRNA-cDNA单一链的合成-cDNA单二链的合成-加接头-与载体连接-体外包装-转染-筛选文库(见总RNA的提取(试剂盒法、氯化锂法和蛋白酶-热酚法)、mRNA的提取及纯化(磁珠法和亲和柱层析法)、cDNA文库构建技术-cDNA链的反转合成)

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