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直接原位PCR

2020.8.11

实验方法原理 原位PCR是原位杂交细胞定位和PCR的高灵敏度相结合的技术,使得靶基因检测有了极大的改进。此技术是在细胞(爬片、甩片或涂片)或组织(石蜡、冰冻切片)上直接对靶基因片段进行扩增,通过掺入标记基团直接显色或结合原位杂交进行检测的方法。

实验材料 细胞或组织样品

试剂、试剂盒 福尔马林二甲苯PBSTris-HCl Triton-X100蛋白酶KPCR反应缓冲液Tag酶Tween-20指甲油无水乙醇苏木素染色液 NP-40NaClMgCl2BSADAB过氧化氢盐酸酒精液

仪器、耗材 玻片湿盒滤纸显微镜

实验步骤

一、组织切片和细胞样品的制备

 

1.  试剂与配置

 

10%福尔马林;二甲苯;PBS。

 

2.  操作方法

 

(1)用10%福尔马林固定组织8~15 h,石蜡包埋,切片(4 μm),将切片置于新鲜的二甲苯中处理5 min,放入无水乙醇中浸泡5 min,取出,空气干燥;

 

(2) 对于培养细胞,可直接制备爬片,也可有PBS洗细胞一次,加10%福尔马林静置过夜,用橡胶刮下细胞;用PBS洗细胞两次,2 000 rpm×3 min,用5 ml PBS重悬细胞,即可用甩片机甩片或直接吸50 μl点在载玻片上。

 

二、切片预处理(蛋白酶消化)

 

1.  试剂与配置

 

0.1 mol/L Tris-HCl (pH7.4)

 

缓冲液A:0.1 mol/L Tris-HCl (pH7.4),0.3% Tween-20,0.5% NP-40

 

蛋白酶K:20-50μ g/ml,溶于TE中

 

2.  操作方法

 

(1)干燥后的切片置于0.1 mol/L Tris-HCl (pH7.4)中,室温孵育5 min;

 

(2)浸入缓冲液A中,室温孵育10 min;

 

(3) 滴加20 μl蛋白酶K液于标本上,在湿盒中37℃孵育20 min;

 

(4)在室温下,用0.1 mol/L Tris-HCl (pH7.4)漂洗两次,每次5m in。

 

三、原位扩增(以标记生物素为例)

 

1.  试剂与配置

 

PCR反应缓冲液:两种引物各100pmol,dATP、dCTP、dGTP和dTTP各200μmol, Bio-dUTP 50mol,1×PCR缓冲液;

 

Tag酶:5U/μl

 

缓冲液B:0.01mol/L PBS,0.1% Triton-X100

 

指甲油(市售)

 

无水乙醇

 

2.  操作方法

 

(1)切片用1×PCR缓冲液平衡3次,每次5 min;

 

(2) 用滤纸吸去切片上多余的液体,置60℃,每片加入30 μl PCR反应缓冲液,5 U Tag酶,用盖玻片封片,四周封以指甲油,防止蒸发;

 

(3) 94℃变性5 min,按下列条件(94℃×2 min,55℃×2 min,72℃×3 min)循环20~25次后,72℃延伸5 min;

 

(4)玻片浸入无水乙醇中10 min,以软化指甲油;

 

(5) 用刀片撬开盖玻片并除去;

 

(6) 用缓冲液B漂洗两次,每次3 min;

 

(7)用无水乙醇固定5 min,并吹干。

 

四、检测(以ABC法为例)

 

1.  试剂与配置

 

缓冲液C:0.1 mol/L Tris-HCl (pH7.5),0.1 mol/LNaCl,2 mmol/L MgCl2, 0.5% Triton-X100

 

封闭液:3%BSA(溶于缓冲液C中)

 

显色液:0.05%DAB,溶于0.05 mol/L Tris-HCl (pH7.4),临用前每10 ml加30%过氧化氢50 μl。

 

1%盐酸酒精液

 

苏木素染色液

 

2.  操作方法

 

(1) 用30 μl 3%BSA滴加在玻片上,封闭1 h;

 

(2)用缓冲液C简洗1 min,每片滴加ABC复合物20~30 μl,室温放置40 min;

 

(3)缓冲液B室温漂洗3次,每次15 min;

 

(4) 滴加显色液于玻片上,镜下观察控制显色时间(一般7~14 min);

 

(5)流水洗片,浸入苏木素液中复染30 s,1%盐酸酒精分化(提抽2次);

 

(6) 常规脱水、透明、封片,镜下观察。


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