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用比较基因组杂交描述染色体结构异常实验(一)

2020.8.24

实验方法原理 比较基因组杂交(CGH)是一种能够在一步全基因组筛查程序,描述G带不能发现的细胞遗传物质增加或减少的分子细胞遗传学技术。CGH优于进行全染色体涂染(wcp)的常规荧光原位杂交(FISH)和多色FISH之处,是它不仅能够识别增加的未知片段的染色体来源,而且还可将该片段定位于特定的染色体区带。采用各种探针进行HSH来确定增加的染色体片段的来源,这个过程昂贵且费力,因为在识别出染色体来源之前,可能需要多种wcp探针。另外,能够得到的位点特异性探针的数量也有限,仅能覆盖基因组的一部分。

实验材料 抽取核型正常男性的外周血牛血清白蛋白

试剂、试剂盒 新鲜配制的固定液秋水仙胺 PRMI胎牛血清青霉素链霉素L-谷氨酰胺植物血球凝集素HEPES缓冲液KClDulbecco 磷酸缓冲液胸苷溶液启动培养基连续培养基福尔马林固定液荧光素-2-dUTP德克萨斯红-5-dUTP整套 dNTP 2-疏基乙醇dNTP 混合物TAE溴化乙锭琼脂糖凝胶

仪器、耗材 巴斯德吸管染色缸PureGene DNA 纯化试剂盒水浴锅

实验步骤

一、正常男性外周血细胞的培养


1.将核型正常男性的500〜650μL新鲜全血加入10mL启动培养基中。


2.37℃条件下培养约72h(3d)。


3.加入200mL胸苷溶液,轻轻混匀。


4.37℃培养14〜18h(过夜)。


5.155g离心10min。


6.弃去上清,加入10mL 1×PBS,颠倒混匀。


7.155g离心10min。


8.弃去上清,加入10mL连续培养基,轻轻颠倒混匀。


9.37℃条件下继续培养4〜5h。


10.加入6或7滴秋水仙胺溶液,颠倒混匀。


11.37℃水浴锅中培养20min。.


12.170g离心10min。


13.弃去上清,留约0.5mL液体。轻弹离心管几次,彻底重悬细胞,避免细胞结块。迅速加入0.5mL 75mol/L KCl(预热在37℃),轻弹离心管充分混匀,继续加入4.5mL KC1。


14.37℃水浴锅中孵育15min。


15.用巴斯德吸管,向每个管中从管底开始缓缓加入1mL新鲜配制的固定液,轻轻颠倒混匀。


16.170g离心10min。


17.弃上清,残留约0.5mL液体。


18.边混匀边逐滴加入新鲜固定液至5mL。


19.室温孵育约10min。


20.170g离心10min。


21.弃去上清,残留约0.5mL液体,将沉淀打散。


22.边混匀边逐滴加入新鲜固定液至5mL。


23.必要的话,再重复步骤20〜22,2或3次。


24.弃去上清。


25.稀释沉淀至适当浓度。溶液应混浊、轻雾状(如果得到沉淀较多,加入1〜1.5mL固定液;如果得到沉淀较少,加入<1mL固定液)。


26.按下述二所述方法滴片。


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