中海大：测序与芯片揭示miRNA调控海参夏眠机制
海参（Apostichopus japonicus），是生活在海边至海底8000米的海洋棘皮动物，以海底藻类和浮游生物为食。当夏季来临，上层海水由于太阳光强烈照射，温度上升。此时，海底的小生物都浮到海面，进行一年一度的大量求食和繁殖。而留在海底的海参，迫于夏季食物中断，进入夏眠，此时，其基础代谢率明显减退，耗氧和氨氮排泄率下降，甚至严重退化为一个很细小的肠纤维。
MiRNAs在低代谢基因调控中的作用研究，是一个新兴的热点。为了确定miRNAs是否对海参夏眠过程具有调控作用，近日，中国海洋大学的陈慕雁博士后领衔的团队和联川生物公司科研团队携手，对海参夏眠过程中的miRNAs进行了深入研究，研究成果发表在10月刊的PLoS ONE上。
研究人员对深度夏眠至少连续15天状态的海参采集样本，并使用经过夏眠后又恢复活动状态的非夏眠海参为对照样本。之后，研究人员采用Solexa深度测序技术分析了海参肠miRNA的表达谱，结果一共鉴定出了308个海参miRNAs，包括18个新的海参特异性miRNAs。其中，有42个miRNAs在海参夏眠阶段具有表达差异，最突出的miRNAs，包括miR-200-3p, miR-2004, miR-2010, miR-22, miR-252a, miR-252a-3p以及 miR-92，在夏眠与非夏眠阶段相比，具有显著的过表达。差异表达的miRNAs通过miRNA芯片和RT-RCR得到了验证（miRNA芯片服务由联川生物完成）。通过预测的miRNA靶基因并进行GO分析表明，这些miRNAs在海参夏眠阶段的全转录水平抑制以及细胞分化中发挥重要作用。
*Chen M, Zhang X, Liu J, Storey KB.（2013） High-Throughput Sequencing Reveals Differential Expression of miRNAs in Intestine from Sea Cucumber during Aestivation. PLoS ONE15；8(10):e76120.[abstract]
来源：杭州联川生物信息有限公司
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标签： miRNA芯片
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