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应用SpectraMax微孔板检测系统和CyQUANT试剂盒检测细胞增殖3

2020.5.05

RNA酶处理、基于DNA含量做标准曲线的CyQUANT实验法

细胞增殖同样可以用DNA含量来评价并作出标准曲线。根据细胞曲线可计算出DNA含量,细胞裂解液经过RNA酶处理就排除了RNA对结果的干扰。在本应用说明中,列出了用DNA含量做标准曲线来定量细胞样品的设置步骤。

准备试剂

步骤1:制备1X细胞裂解液,用蒸馏水以1:20稀释细胞裂解液储存液,需制备每孔200μL。一部分细胞裂解液加入1mMEDTA和180mMNaCl,一部分不加EDTA和NaCl。

步骤2:制备1X和2XCyQUANTGR染液/细胞裂解液,用1X细胞裂解液以1:400或1:200稀释CyQUANTGR染液储存液。稀释液需置于塑料器皿中,而非玻璃器皿中。

在塑料管中制备DNA标准样品

步骤1:用1X细胞裂解液稀释试剂盒中100μg/mLDNA标准样品,稀释成1μg/mL存储液。

步骤2:将DNA存储液按表4所列按梯度稀释。

注意:CyQUANT试剂盒中的是λ噬菌体DNA,本文中的数据都是按标准梯度稀释。对于自己的实验也可选择其他来源的DNA样品,具体操作请参考产品说明书MP-7026。

准备细胞

依据所用的细胞系(贴壁还是不贴壁),按照Life Technologies的CyQUANT说明书选择适当的细胞培养(微孔板中还是培养皿中)和冻存方法,在-70℃冻存细胞。本文中,贴壁细胞要先从培养皿中消化下来,然后离心,并将离心得到的细胞斑块冻存。

准备细胞样品、标准曲线DNA样品和空白

步骤1:将之前冷冻的离出细胞放在室温几分钟解冻。加入1mLCyQUANTGR染液/细胞裂解液,涡旋使细胞重悬。

步骤2:预处理细胞,每孔中加入含1mMEDTA和180mMNaCl的细胞裂解液,并在4个没有细胞的孔中加入同样的细胞裂解液(空白对照孔)。如果样品为之前冷冻的细胞离心斑块,先用100μL裂解液重悬,然后转移到微孔板中。在有细胞的样品孔和空白对照孔中分别加入4μLRNA酶(每孔两个单位,详见下文)。室温孵育1小时。

注意:无DNA酶的RNA酶处理细胞时浓度不超过10μL中含有饱和活性单位。例如,试剂盒中混合RNA酶浓度为500U/mL,所以每4μL中含有两个活性单位。

步骤3:在有细胞的样品孔和空白对照孔中分别加入100μL2XCyQUANTGR染液/细胞裂解液。

步骤4:将之前准备的DNA梯度稀释液依次加入到微孔板中,孔板中因包含两种对照,一种是加入稀释液但无DNA的空白对照,另一种是只含有1XCyQUANTGR染液/细胞裂解液的孔板空白对照(无DNA和RNA酶)。

步骤5:室温孵育2-5分钟

设置仪器和软件参数

步骤1:打开微孔板读板仪开关,打开SoftMaxPro软件并点击ProtocolLibrary中CellGrowth&Viability文件夹中的CyQUANTFluorescenceprotocol。

步骤2:按表2中所示参数设置仪器,此设置已在预配置的列表中。

步骤3:使用TemplateEditor设置孔板加样的模板,包括标准样品孔、孔板空白对照孔和样品孔(RNA酶处理的细胞)的位置。

读板和数据分析

步骤1:将微孔板放于读板机中。

步骤2:点击软件的Read键。

步骤3:仪器将对微孔板进行读值后,相关的荧光值(RFUs)将出现在软件的孔板位置,数据将依据设置分析出结果,并显示在Grouptables中。

步骤4:TemplateEditor里设置了标准曲线组的话,DNA标准曲线将会有软件自动生成。

步骤5:在CurveFit下拉菜单里可以选择拟合曲线公式,本应用说明的标准曲线选择的是log-log曲线拟合。

步骤6:软件通过标准曲线公式计算出每个DNA样品的浓度,并显示在Unknownsgroup部分。

20171011155654296.jpg

DNA标准曲线结果

基于细胞的标准曲线如前文所述,呈现在图3中。在生成标准曲线时采用了log-log拟合算法,图中所示结果是SpectraMaxM5微孔板读板机得到的,MolecularDevices公司的其他具有荧光功能的读板机均可得到相似结果(数据未显示)。用RNA酶处理细胞检测DNA含量做标准曲线的例子现实在表5中。在此应用说明中,一个系列的细胞浓度被计算。事实上,每孔细胞个数在50-50,000个之间(标准曲线范围内)均可用此方法计算得到细胞DNA浓度。

图4显示横坐标为每孔细胞个数,纵坐标为平均DNA含量,曲线范围为50-50,000个细胞,结果如试剂盒说明书所述。图5中显示了RNA酶处理的和未处理的细胞样品RFUs值的比较,说明RNA酶处理会降低细胞裂解液的荧光强度。

总结

CyQUANT细胞增殖实验是快速的、灵敏的检测细胞个数和细胞DNA含量的荧光方法。SpectraMax M5微孔板读板机得到的数据结果与Molecular Devices公司的其他具有荧光功能的读板机得到的结果相似。基于细胞的标准曲线和5分钟的孵育,我们得到了与CyQUANT试剂盒相似的动态范围(50-50,000个细胞)。应用λ DNA样品得到的曲线及通过标准曲线计算DNA含量的下限位50个细胞。结合应用SoftMaxPro的软件分析功能及预置的CyQUANT拍摄设置,提供了一个计算和得到数据便捷的方法。



参考文献

1. Life Technologies Product InformationsheetMP 7026 1/12/01: CyQUANT CellProliferation Assay Kit (C-7026).


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