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Alpha®-CETSA®方案细胞水平小分子结合相应靶向蛋白的验证

2020.8.11

  我们不再是我们,我们依然是我们——当Alpha®遇上CETSA®

  小分子药物研发中,筛选能有效结合目标蛋白的分子是非常耗时耗(财)力的一个环节,但又是必须进行的工作。高失败率源于结合情况的错综复杂,体外生化实验的结合效果,往往不能很好的在细胞水平进行重现。这其中可能是因为分子在穿越细胞膜时,出现了被修饰;也可能是因为纯化蛋白和真实细胞环境的蛋白构象不同。例如,在生化水平显示很好结合效果的分子,在细胞水平可能结合的是另一个蛋白。是不是很崩溃……

  试想,如果有一个高通量解决方案让你可以直接在细胞水平进行小分子结合相应靶向蛋白的验证,开不开心,意不意外?

  这个方案就是Alpha®-CETSA®!

  什么是CETSA®?

  CETSA®是细胞热迁移实验(Cellular Thermal Shift Assay)的简称,是PELAGO公司2012年在欧洲注册的ZL技术。该技术基于的原理是:每种蛋白质都有自身的热熔曲线(如下图)。随着温度的升高,蛋白质会发生降解(蓝色曲线);当蛋白质结合小分子以后,该复合蛋白的热熔曲线会右移(红色虚线),即相同温度下,未降解蛋白的量会提高。CETSA®实验的样品来源十分灵活,可以是细胞,也可以是活体给药以后的组织样本。

  传统的CETSA®对于天然构象蛋白的检测模式主要有Western-Blot和MS方法,这两种方法都无法实现高通量的筛选。2019年7月,PELAGO公司正式和PerkinElmer公司达成战略合作协议,推出高通量,高灵敏度的CETSA®HT检测方案,即Alpha®-CETSA®

  Alpha®-CETSA®的操作

  1.样品和化合物进行孵育。

  2.进行热休克操作(建议在PCR仪上进行该操作)。

  3.加入合适的裂解液。

  4.加入Alpha® CETSA®检测试剂。

  5.在具有Alpha®功能的酶标仪上检测。

  最新酶标仪加载Alpha®功能

  PerkinElmer公司的Victor NIVO最新款酶标仪加载了Alpha®功能,这是目前可以开展Alpha®CETSA®检测细胞水平蛋白-分子相互作用的最小的仪器。

  目前,PerkinElmer和PELAGO一起推出的蛋白靶点试剂盒有Akt1,BCL-2,EGFR,MEK1和p38 MAKP,工具微珠2套,方便客户灵活使用这项技术。更多的商品化试剂盒也会陆续推出。


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