外显子组测序发现新的单基因疾病
根据《美国人类遗传学杂志》本周发表的一篇文章，CHAMP1基因上新获得的突变可能导致一种疾病，具体特征为语言障碍、智力缺陷和一些罕见的面部特征。
德国和荷兰的研究小组对五名儿童开展了外显子组测序。这五个人没有亲属关系，但都有着严重的语言障碍、智力缺陷，以及罕见但类似的面部特征。将这些儿童的蛋白编码序列与其父母进行比较，研究人员发现染色体配对相关基因CHAMP1出现了新生的移码或无义突变。
作者认为，对于那些症状与已知的遗传综合征重叠，比如Prader-Willi综合征或Angelman综合征，但相关突变检测结果为阴性的儿童，可以考虑CHAMP1检测。“我们认为，对未分类或轻度的畸形，尤其是肌张力减退和严重的语言发展迟缓，应当考虑CHAMP1检测，”他们写道。
许多新生突变都与各种形式的智力缺陷和其他类型的发育迟缓有关联。在这项研究中，研究人员关注了其中一种形式，它的特点是嘴唇和鼻子异样，并且说话困难，动作改变。
研究人员利用安捷伦的SureSelect XT Human All Exon V5对每位患者及其父母的基因编码序列进行捕获，之后利用Illumina的HiSeq 2500或ABI SOLiD 5500XL仪器进行测序。
通过分析，他们追踪到13号染色体CHAMP1基因中的两个移码突变和三个无义突变。CHAMP1改变只在患有疾病的儿童中出现，而父母的外显子组序列中没有。出人意料的是，研究人员发现两名不相关的个体有着相同的无义突变。
研究人员预测，CHAMP1基因的改变可能影响蛋白产物的锌指结构域。在细胞分裂过程中，这个蛋白通常位于有丝分裂纺锤体中，介导着丝粒与染色体分离的所需的微管相连。不过，此基因的功能丧失突变却没有出现在各大数据库中，比如dbSNP136或千人基因组计划的序列数据。
作者认为，与染色体配对相关的基因改变往往导致发育迟缓，表明CHAMP1代表了一个有吸引力的候选基因。“我们的数据进一步凸显了着丝粒和染色体配对在人类神经发育和功能中的重要性。”
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