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细菌人工染色体的应用

2020.8.10

实验方法原理 细菌人工染色体(bacterial artificial chromosome, RAC ) 是以大肠杆菌致育因子 (fertility, F)为基础的合成载体。

实验材料 限制性内切核酸酶大肠杆菌培养物电转感受态大肠杆菌细胞

试剂、试剂盒 LB 冷冻缓冲液

仪器、耗材 脉冲场凝胶电泳仪LB 琼脂平板LB 培养基电穿孔仪

实验步骤

一、材料


1. 缓冲液与溶液


LB 冷冻缓冲液


2. 酶与缓冲液


限制性内切核酸酶


3. 凝胶


脉冲场凝胶电泳仪


4. 培养基


含 12.5 μg/ml 氯霉素的 LB 琼脂平板


含 12.5 μg/ml 氯霉素的 LB 培养基


5. 专用设备


电穿孔仪


6. 载体与菌株


BAC DNA 或 BAC 分离物转化的大肠杆菌培养物


冷冻的电转感受态大肠杆菌细胞


二、方法


1. 制备新鲜的 BAC 转化子。


(1) 如果 BAC 是以 DNA 的形式提供的


① 用电穿孔法将 BAC DNA 导入大肠杆菌(DH10B 菌株)中。


② 从每批电穿孔后的菌液分别取出 2.5、25 和 250 μl,涂布于含 12.5 μg/ml 氯霉素的 LB 琼脂平板上。37℃ 温育平板 16~24 h。


(2) 如果 BAC 是以转化菌液的形式提供的


① 立即在含 12.5 μg/ml 氯霉素的 LB 琼脂平板上划线培养。


② 37℃ 温育 12~16 h。


2. 挑选 12 个转化菌落,分别加入 5 ml 含 12.5 μg/ml 氯霉素的 LB 培养基中。37℃ 剧烈振摇过夜。


3. 在每 12 管 5 ml 培养液中各取 1 菌环,分别接种于 LB 冷冻培养基中培养。待细菌生长后,转移至 -20℃ 冷冻保存。


4. 从步骤 2 每个 5 ml 菌液中取 4.5 ml,纯化 BAC DNA。


5. 分析 BAC DNA


(1) 用 PCR 法或用 SouAem 杂交鉴定 BAC 含有染色体的目的区域。


(2) 用限制酶切和 PFGE 检测插入片段的大小。


6. 根据检测结果,选一个或多个 BAC 作进一步分析。


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