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去甲基化酶ALKBH5在胰腺癌中的应用(二)

2021.3.01

4.ALKBH5抑 制胰腺ai细胞生长和转移
将过表达ALKBH5的ai细胞移植到裸鼠体内,发现过表达ALKBH5的ai细胞生成的肿 瘤体积明显小于对照组,并且细胞生长的指示分子Ki-67的表达也明显降低。染色显示过表达ALKBH5的组织中侵袭和转移的指示分子MMP-2和MMP-9表达降低,敲降ALKBH5的组织中两分子则升高。原位和异种移植模型中都得到了相似的结果。

ALKBH5抑 制胰腺ai细胞生长和转移
 

5.ALKBH5作用于PER1调控胰腺ai细胞
作者通过ELISA发现过表达ALKBH5的细胞中m6A整体水平下降。于是通过m6A-seq(云序提供服务)进一步寻找去甲基化酶可能作用的靶基因。比较过表达ALKBH5的细胞,对照细胞中发现了7226个特有的甲基化位点,其中应含有ALKBH5作用的基因。通过对RNA-seqm6A-seq(云序提供服务)两组学联合分析,筛选出78个表达和甲基化水平都明显差异的基因,再与7226个对照组特有甲基化位点所在的基因取交集, 筛选出9个基因。再结合可视化,锁定了3’UTR区有明显m6A峰的基因PER1。
 

ALKBH5作用于PER1调控胰腺ai细胞
 

6.缺少ALKBH5引发m6A识别蛋白YTHDF2诱导的mRNA降解,导致PER1的mRNA水平降低
qPCR显示ALKBH5过表达细胞中PER1表达升高,ALKBH5敲降细胞中PER1表达降低, 表明ALKBH5可调控PER1表达。MeRIP-qPCR(云序提供服务)则验证了过表达ALKBH5降低PER1的m6A水平。双荧光素酶实验(云序提供服务)进一步验证了ALKBH5作用在mRNA上的motif序列并能调控PER1的表达水平。另外由于PER1 mRNA上m6A位点与识别蛋白YTHDF2的结合位点临近,作者进行了敲降实验,发现敲降YTHDF2也能导致PER1 mRNA水平升高。这些结果表明,ALKBH5的敲降,导致PER1 mRNA的m6A水平升高,进而被YTHDF2识别增强了mRNA降解。
 

缺少ALKBH5引发m6A识别蛋白YTHDF2诱导的mRNA降解,导致PER1的mRNA水平降低


7.PER1抑 制胰腺ai细胞
为了验证PER1对胰腺ai的影响,作者首先通过qPCR验证了42个患者的肿 瘤组织中PER1表达降低。生存分析显示PER1低表达和总生存率的降低有相关性,并且对TCGA数据库数据的分析表明PER1表达与ALKBH5水平正相关。CCK-8, EdU 和 transwell实验验证了PER1异位表达可抑 制胰腺ai进展,并部分缓解ALKBH5敲降带来的细胞增值和侵袭。另外,作者还发现了回补PER1表达导致 ATM依赖信号通路的重激 活,包括p-ATM, p-CHK2, p-CDC25C, p-P53, P21,和p-CDK表达的上升。CoIP(云序提供服务)实验也验证了ATM和PER1的相互作用。
 

PER1抑 制胰腺ai细胞


8.PER1诱导恢复P53表达增强ALKBH5转录
作者发现PER1过表达引起P53升高后,ALKBH5水平也随之升高,同时免疫染色也显示整体m6A水平降低。于是为了验证P53和ALKBH5的关系,通过ChIP实验和双荧光素酶实验(云序提供服务),验证了P53与ALKBH5的启动子区结合,激 活ALKBH5的转录。
 

PER1诱导恢复P53表达增强ALKBH5转录




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