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酿酒酵母的生长及其DNA的制备

2020.8.10

 实验方法原理 用这一方法制备的 DNA 适用于琼脂糖凝胶电泳、Southern 印迹、亚克隆、基因组文库构建、PCR 或其他不需要完整的高分子质量 DNA 的方法。

实验材料 YAC 克隆的酵母菌落

试剂、试剂盒 醋酸铵乙醇酚氯仿TETriton SDS 溶液

仪器、耗材 YPD 培养基Sorvall SS-34 转头或同类产品玻璃珠

实验步骤

一、材料


1. 缓冲液和溶液


醋酸铵(10 mol/L )


乙醇


酚:氯仿(1:1,V/V)


TE ( pH 8.0)


含 20 μg/ml RNase 的 TE ( pH 8.0)


Triton/SDS 溶液


2. 培养基


YPD 培养基


3. 离心机和转头


Sorvall SS-34 转头或同类产品


4. 专用设备


玻璃珠


5. 载体和酵母菌株


携带目的 YAC 克隆的酵母菌落


二、方法


细胞培养


1. 将一个含目的 YAC 克隆的酵母菌落接种到 10 ml YPD 培养基中,30℃ 振摇过夜。


2. 2000 g ( Sorvall SS-34 转头,4100 r/min) 离心 5 min 收集细胞。


3. 弃去培养基,加 1 ml 无菌水,轻轻振动,使细胞悬浮于溶液中。


4. 按步骤 2 的方法收集细胞。


5. 去除上清,将细胞重悬于 0.5 ml 无菌水,然后移入一 1.5 ml 无菌离心管中。


6. 室温下在微量离心机中以最大转速离心 5 s,去除上清,收集细胞。


DNA 的提取


7. 加入 0.2 ml Triton/SDS 溶液于细胞中,轻叩离心管侧壁,使细胞沉淀重新悬浮。


8. 加入 0.2 ml 酚: 氯仿和 0.3 g 玻璃珠。室温振荡 2 min。加 0.2 ml TE ( pH 8.0),稍加振荡,使体系混匀。


9. 室温下,在微量离心机中以最大转速离心 5 min,使有机相和水相分开。将上层水相移入另一新的离心管中。小心操作,避免将两相界面处的物质吸入。


DNA 的分离


10. 加入 1 ml 乙醇到水相中,盖上管盖,将小管轻轻翻转数次,混匀。


11. 在微量离心机中以最大转速 4℃ 离心 2~5 min, 使 DNA 形成沉淀。用巴斯德吸管吸去上清。再次进行短暂的离心(2 s ), 除去离心管底部最后残余的乙醇。


12. 用 0.4 ml 含 RNase 的 TE ( pH 8.0 ) 溶解核酸沉淀,然后在 37℃ 温育 5 min。


13. 加入等体积酚: 氯仿溶液抽提经 RNA 酶消化后的溶液。最好用翻转离心管的方法混匀,不要用涡旋振荡。室温下,在微量离心机中以最大转速离心 5 min, 使水相和有机相分层。将水相移入另一新离心管中。


14. 在水相中加入 80 μl 10 mol/L 醋酸铵和 1 ml 乙醇。轻轻地翻转小管进行混匀。室温放置 5 min。


15. 微量离心机离心 5 min 收集 DNA 沉淀。弃上淸,用 0.5 ml 70% 乙醇灌洗核酸沉淀。 以最大转速离心 2 min, 用巴斯德吸管吸去乙醇漂洗液。再次进行短暂的离心(2 s), 吸去离心管底部最后残余的乙醇。将 DNA 沉淀在空气中干燥 5 min,然后用 50 μl TE (pH 8.0) 溶解。


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