关注公众号

关注公众号

手机扫码查看

手机查看

喜欢作者

打赏方式

微信支付微信支付
支付宝支付支付宝支付
×

强强联合(脂质组+DIA),IF>10(一)

2020.4.10

脂质组学技术 

相比其他组学技术,脂质组学技术发展较晚,新颖性高,仅仅只是纯数据分析也可以发表在不错的期刊上。如果希望研究得更高深入,可以往下游脂质功能或者往上游的蛋白或基因出发研究脂代谢调控机制。

DIA技术

新一代、革命性的蛋白质组技术DIA,相比传统的蛋白质组技术(shotgun,Label free、iTRAQ或TMT等)以及4D 蛋白质组学,具有覆盖度高、重现性高、定量准确性高(可以达到与MRM/PRM相近的水平)等优势,被美国癌症登月计划、瑞士苏黎世癌症地图计划、澳大利亚ProCan项目等国家级精准医疗项目采用,并且在出现在越来越多的高水平研究中。

脂质组+ DIA强强联合,会擦出什么样的火花呢。今天跟小编一起来看一篇最新发表在Biological Psychiatry IF= 11.982的文章吧!这篇文章利用脂质组+DIA揭示了精神病经历患者的早期脂代谢特征及与相关蛋白的相互作用关系。

Integrated Lipidomics and Proteomics Point to Early Blood-Based Changes in Childhood Preceding Later Development of Psychotic Experiences: Evidence From the Avon Longitudinal Study of Parents and Children

2019 Biological Psychiatry  IF= 11.982

研究材料:115名参与者12岁时的血浆样本

技术:脂质组+蛋白DIA

精神疾病(包括精神疾病和情感疾病)的早期诊断和治疗可以显著改善他们的临床结果。过去15年的研究表明,一般人群中8%到17%的儿童和青少年、7%的成年人有精神病经历,其中早期存在亚临床症状的个体有更高患精神病或其他疾病的风险。对精神疾病的生物特征识别有助于这些疾病的病理生理学研究,以及筛选具有早期检测和诊断潜力的生物标志物。

1.>>>研究队列<<<

通过多年的随访,本次研究选择了115名参与者,其中实验组PEs 48名(12岁时无精神病经历,而在18岁时有确切的精神病经历),对照组Control 67名(12岁时无精神病经历,而在18岁时有有确切的精神病经历)。两组在性别、BMI以及社会地位上无明显差异。与对照组相比,PEs组有9例达到抑郁标准,正常对照组无一例。

1

2.>>>脂质组学分析结果<<<

对115名参与者12岁时的血浆样本进行脂质组学分析,一共检测到61种PC脂质分子和11种LPC脂质分子。通过单变量统计分析,一共筛选到34种脂质分子。FDR校正后,16种脂质分子仍然在PEs组含量上调。比较有趣的是,单变量分析与多变量分析的结果具有一致性。

2

3.>>>蛋白组分析结果<<<

前期的研究结果表明精神障碍症患者儿童时期凝血途径异常,因此此次研究对115名参与者12岁时的血浆样本,采用DIA技术检测凝血途径中的22个蛋白。通过单变量统计分析,一共筛选到3种凝血蛋白。FDR校正后,只有1种蛋白(PLG)仍然在PEs组含量上调。

4.>>>脂质组+蛋白组<<<

凝血和补体途径蛋白在功能上密切相关。由于这个原因,作者将能够获取的补体途径中的蛋白也纳入了联合分析。相关性分析结果表明17种脂质分子与6种蛋白正相关,其中凝血途径的PLG,heparin cofactor 2以及补体途径中的vitronectin具有很强的相关性。

4

5



推荐
热点排行
一周推荐
关闭