云序超微量MeRIP测序技术在m6A甲基化文章发表的应用-1
m6A甲基化是近年来一大热门研究方向，种种研究表明m6A修饰在各种真核生物、各类组织细胞中普遍存在，并对多种生物学功能、疾病肿瘤的发生发展具有极大影响。m6A甲基化位点的检测依赖于MeRIP-seq，其中的抗体免疫共沉淀（IP）环节要求样品RNA起始量相较普通转录组测序要高，曾经令许多难以大量获取的组织、细胞或体液样本被拒在m6A研究的大门之外。
云序生物自2018年推出了超微量RNA甲基化测序（超微量MeRIP-seq），对免疫共沉淀和高通量测序步骤进行优化，克服了常规抗体富集至少需要100μg总RNA的难题，实现了仅需500ng总RNA即可IP、建库测序，为微量样本研究m6A等甲基化修饰带来福音。本期我们就为大家解析两篇云序客户近期发表的应用了超微量merip技术测序的m6A表达谱文章。
文章1：高度近视眼晶状体前囊膜的m6A修饰谱
发表日期：2020.10.27
研究单位：天津医科大学眼科医院孙靖教授团队
影响因子：4.251
研究方法：m6A-MeRIP-seq，RNA-seq
样品类型：单纯白内障患者和高度近视的白内障患者晶状体前囊膜
样本数量：3 ：3
RNA量：低至500ng
文章链接：Comprehensive analysis of transcriptome-wide m6A methylome in the anterior capsule of the lens of high myopia patients
文章解析：
1）m6A位点的统计和分布
文章通过m6A-MeRIP-seq，在单纯白内障患者和高度近视的白内障患者晶状体前囊膜中分别检测到13617和8569个m6A位点，发生m6A修饰的基因分别为8196和5896个。文章展示了两组中m6A位点的分布和motif序列，并对具有单个和多个m6A位点的基因进行了统计。
2）m6A修饰基因的功能
为了探究m6A修饰与高度近视的关系，文章对两组间差异基因进行了GO和KEGG分析，发现m6A修饰差异基因多与细胞外基质的结构变化和形成有关。
