5日弹指一挥,第二届美国华人质谱会CASMS落幕
美国东部时间2022年10月21日,第二届美国华人质谱学会(CASMS)学术研讨会暨展览会在Gather Town迎来最后一天的日程。本届会议以“Advancing Biological and Pharmaceutical Mass Spectrometry”(推动质谱在生物与药物领域的技术应用发展)为主题,共邀请超过60位来自美国、加拿大、中国、荷兰以及新加坡等国家的科研学界以及工业界的杰出研究人员带来精彩演讲。分析测试百科网作为会议支持媒体全程为您报导。
本次大会闭幕报告将话筒递交给美国默沙东科学助理副总裁Kevin Bateman博士。他报告的题目为“Mass Spectrometry in Industry: Innovation and Opportunity”。 Kevin Bateman介绍到,随着质谱技术的发展,科研对质谱的依赖性逐渐增加,世界市场对质谱的需求也逐渐上升。
质谱技术现阶段已经可以解决很多10年前无法想象的问题。但现阶段质谱仍面临着新的挑战。Kevin Bateman表示,现阶段质谱的灵敏度、碎片化、改进药物代谢鉴定、通量和自动化等方面已经难以满足日益增长的科研需求。Kevin Bateman介绍了他现在的项目:建立AE-MS实验,建立了一个模型,根据可利用化合物的反应预测化学实体在选定基质中的大体积化学空间响应;并通过预测的响应与置信区间来近似化学实体浓度。简单来说说就是通过已知的数据构建的大数据集,预测尚未实行实验中出现的问题,并预先改进实验方法使实验得以自动化。
针对以后基于大数据的自动化是否会替代人工,Kevin Bateman持积极态度。他认为,机械自动化的实验毫无疑问会代替一些人工工作,但是这些往往是重复性的工作。如果可以实现实验研究工业化,科研工作者将会从大量基础性的研究工作中解放出来,进而把精力投入在更为尖端、更具开创性的工作上。
随后,CASMS大会主席Lan Huang宣布了本届大会“Poster Award Winners”名单,蛋白质组学组包括中国西湖大学Li Lu、密歇根大学Fengchao Yu、乔治华盛顿大学Ashley Frankenfield等7人;小分子组包括弗罗里达大学Julia Bonney、清华大学 Hengxue Shi、俄拉克荷马州大学 Zongkai Peng等7人。获得“Committee on CASMS Poster Awards”有Yue Chen、Ling Hao、Lingjun Li等9人获得。获得“Lightning Talk Award”有新泽西理工大学Yongling Ai、威斯康星大学麦迪孙分校Elizabeth Bayne、南京医科大学Yun Chen等8人。最后大会主席Lan Huang感谢所有所有参会人员在过去5天内的参与和付出,并希望能在下次大会与大家再次相遇。
Poster Award Winners获奖名单
Committee on CASMS Poster Awards获奖名单
Lightning Talk Award获奖名单
专题报告:用于生物标志发现的集成多组学研究
报告题目:LC-MS/MS-based metabolomics in identification of novel therapeutic targets and risk factors of gut diseases
报告人:新加坡国立大学Guodong Zhang副教授
Guodong Zhang团队主要研究如何降低结肠炎和结肠癌的风险。在研究中,Zhang借助LC-MS/MS分析工作流程发现CYP环氧酶十二烷基途径在结肠癌中其关键作用,这一发现表明植物油的主要成分—亚油酸是诱发结肠癌的危险因素。另外,团队也发现sEH是诱发肥胖疾病的新靶点。
报告题目:Applying JUMP software pipeline to decode TMT-LC/LC-MS/MS based whole proteome and phosphoproteome
报告人:美国田纳西州圣犹达儿童研究医院高级生物信息学研究科学家 Zuo-fei Yuan
Zuo-fei Yuan介绍了使用的JUMP软件,该软件可以定量分析全蛋白组和磷酸化蛋白质、绘制全蛋白组表达谱、磷酸化蛋白质组的表达谱和激酶分析,并且可完成全蛋白组和磷酸化蛋白质批量定量分析。
报告题目:Web-based tools for comprehensive multi-omics analysis
报告人:麦吉尔大学Jessica Ewald
多组学与单一组学相比可以获得更多的数据,有助于提供正交信息或减少因冗余信息造成的少报、误报。Jessica Ewald报告了通过基于网络工具构建了多组学集成网络,其可以应对多组学复杂的结果,并将结果可视化帮助后期分析解释。
报告题目:Multi-omics analysis of colon mucosa and wall from patients with Crohn’s Disease
报告人:AbbVie生物研究中心高级科学家 Liang Jin
炎症性肠病(IBD)是一种消化道组织慢性炎症的疾病,包括克罗恩病(CD)和溃疡性结肠炎(UC)。Liang Jin团队采用不同的多组学整合方法分析分离的CD患者结肠粘膜和肠壁的转录组学和蛋白组学数据,利用蛋白质基因组学可以揭示得到更具体的独特信息。
报告题目:A new perspective for aging research: the proteome that decorates reactivated heterochromatin
报告人:美国纽约阿尔伯特爱因斯坦医学院 Simone Sidoli副教授
Simone Sidoli关注以多组学的方法研究衰老和致病的机制,寻找影响衰老或引起异常的分子标志物,将有助改善人类健康,将人类寿命在延长到一个新的高度。Simone Sidoli团队开发了一个模型,调查重新激活的异染色体、假转录和蛋白质组的解码染色质结构,并确认了EXOSC 4是维持异常解码染色质保持低转录水平的关键因素。
报告题目:The unknown and unidentified gaps in biochemical networks, or the triangle affairs between genome, metabolome and exposome
报告人:美国康涅狄格州法明顿杰克逊实验室 Shuzhao Li副教授
代谢模型可以预测多组学整合信息。Shuzhao Li团队构建了代谢组学的概率代谢物和网络模型,解决了代谢组学信息组装的问题。
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