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植物基因组DNA的RFLP多态性分析

2020.9.08

一、原理

DNA多态性是指DNA碱基顺序的差异性。这种差异性不仅存在于不同的植物之间,也存在于同一种植物的不同个体之间。RFLP多态性是指DNA限制性内切酶酶切片段长度的多态性(restniction fragment length olymophorphism)。由于碱基顺序的差异,在不同的种或同一个种的不同个体之间,它们的基因组DNA限制性内切酶位点的种类和数目不同,经特定的限制性内切酶切割后,所产生的限制性酶切片段在大小(长度)和数目方面自然也存在着差异。通过琼脂糖凝胶电泳分离和溴化乙锭染色,在紫外检测仪下观察,即可直接看到这种差异。电泳分离后,通过Southern杂交也可显示出已知DNA片段的差异。

二、目的

通过本实验了解不同植物或同一植物不同个体之间基因组DNA顺序的差异性,掌握DNA限制性酶切片段长度多态性研究的基本方法。

三、材料和试剂

1、从不同植物或同一植物不同个体分离出的基因组DNA。

2、限制性内切酶。

3、10×限制性内切酶缓冲液。

4、0.5M EDTA(pH 8.0)

5、溴化乙锭。

6、琼脂糖。

7、电泳仪和电泳槽。

四、操作步骤

(一)限制性内切酶酶切。

1、将在-20℃冷冻的DNA在冰上融化。

2、取8支微量离心管按下表所示作好标记

,并依次加入所需成分。


品种I 品种II 品种I-1 品种II-2



单酶切 1# 双酶切 2# 单酶切 3# 双酶切 4# 单酶切 5# 双酶切 6# 单酶切 7# 双酶切 8#
DNA 10 10 10 10 10 10 10 10
10×缓冲液 2 2 2 2 2 2 2 2
Eco R I
1 1 1 1 1 1 1
Hind III
1
1
1
1
无菌水 7 6 7 6 7 6 7 6
总体积(ul) 20 20 20 20 20 20 20 20

3、混匀,慢速离心2秒,使溶液全部聚于管底。

4、37℃保温2-3小时。

5、加入1/10体积的0.5M EDTA溶液终止反应。

(二)琼脂糖凝胶电泳分析


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