催化酶的结构基础
参与翻译生化反应的有多种酶，但其核心生化反应主要由两类酶参与：催化腺苷化反应和tRNA装载的氨酰-tRNA合成酶、催化肽键合成的核糖体核酶。下面将进一步探讨这两种酶的结构生物学基础，以及它们确保反应准确发生的校正机制。
氨酰-tRNA合成酶
氨酰-tRNA合成酶有四个结构域和三个活性位点。由于每种tRNA只能结合特定氨基酸，所以氨酰-tRNA合成酶必须确保tRNA和氨基酸之间的正确配对。
其四个结构域分别结合tRNA受体臂（第1结构域）、反密码子区域（第2结构域，其中1个碱基用来被识别）、ATP和正确AA（第3结构域）、错误AA（第4结构域）。
三个活性位点分别位于第1结构域（催化tRNA装载）、第3结构域（催化腺苷化反应）、第4结构域（催化错误氨基酸水解）。
错误氨基酸在这里一般指的是和该tRNA不匹配，但又由于化学性质类似而容易被错误装配的氨基酸。氨酰-tRNA第3结构域内的AA结合位点对于匹配的正确AA具有高亲和力，而对错误AA亲和力较低，但依然会有概率结合而催化后续的两步反应。但由于第4结构域对错误AA的高亲和力，可以大概率将周围的错误AA先行“捕捉”并且水解，防止其参与后续反应。这就是氨酰-tRNA合成酶的第一个校正机制，是化学或酶学机制。
第二个校正机制是动力学机制。正确的AA和tRNA组由于在合成酶中处于正确的位置而更容易得以被催化，导致反应的发生。
值得注意的是，翻译和转录的校正机制往往没有基因复制的高保真度。从生物学意义角度来看，翻译的单个氨基酸出错只会影响一个蛋白的功能，而基因复制错误则可能会影响一类蛋白终生的表达。
核糖体核酶
核糖体由大小两个亚基组成，其rRNA占到组分的50%，剩余的50%是一些小型蛋白。蛋白质的主要作用是维持rRNA的正确折叠，但值得注意的是，所有的催化作用都是rRNA介导的。
核糖体有两个通道：mRNA-tRNA通道（贯穿三个tRNA结合位点：A、P、E）和肽链出口通道。大部分新合成的肽链都是在离开核糖体后才开始折叠，而在肽链出口通道可以先行形成α螺旋。
核糖体的三个位点各自结合不同的组分。A位点结合AA-tRNA，P位点结合肽链-tRNA和起始AA-tRNA。E位点结合即将释放的tRNA。最重要的肽键合成发生于A位点和P位点之间，故位于这两个位点的tRNA的受体臂3'端在空间结构上距离很近以方便反应的发生，而E位点则距离较远。在A、P位点的tRNA均和mRNA存在氢键互作，而在E位点的tRNA距离mRNA较远，并无互作，方便其尽快脱离。
在核糖体中，有两个重要的区域：肽酰转移中心（肽键合成）和解码中心（mRNA-tRNA互作）。在tRNA和rRNA的共同作用下，肽酰转移得以催化。而tRNA的正确匹配在肽键合成过程中是必须的（详见下文翻译的延伸）。
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