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DNA核酸浓度的测定实验

2019.4.13

DNA核酸浓度的定量实验可以用于(1)对纯化的PCR产物进行浓度测定;(2)对纯化的酶切产物进行浓度测定;(3)对提取的质粒进行浓度测定。

实验方法原理

寡核苷酸,单链、双链DNA,以及RNA可以定量溶于缓冲液,构成核酸的嘌呤碱和嘧啶碱具有共轭双键,使核苷核和核酸在紫外线光具有特征性的吸收光谱,最大吸收峰为260nm。窄光带紫外分光光度计,长260nm.,比色杯光径1cm,1个吸光度值(1A)相当于50ug/ml双螺DNA,40ug/m1单螺旋DNA或RNA),20 ug/ml寡核苷酸。

测试前,选择正确的程序,输入原液和稀释液的体积,尔后测试空白液和样品液。然而,实验并非一帆风顺。读数不稳定可能是实验者最头痛的问题。灵敏度越高的仪器,表现出的吸光值漂移越大。


实验材料

样本DNA

试剂、试剂盒

双蒸水

仪器、耗材

紫外分光光度计比色杯

实验步骤

1. 取DNA溶液10ul,加双蒸馏水600ul(即稀释61倍)。

2. 用双蒸馏水调零,测定260nm和280nm的吸光度值(A260. A280).

3. DNA浓度(ug/ul)=A260x 50x 61/1000

4. DNA纯度:A260/ A280的比值应大于1.7以上,若样品中含有蛋白质(吸收峰在280nm)等杂质时,比值下降,应重新纯化.

注意事项

在测试时,离子浓度太高,也会导致读数漂移,因此建议使用pH值一定、离子浓度较低的缓冲液,如TE,可大大稳定读数。样品的稀释浓度同样是不可忽视的因素:由于样品中不可避免存在一些细小的颗粒,尤其是核酸样品。这些小颗粒的存在干扰测试效果。为了最大程度减少颗粒对测试结果的影响,要求核酸吸光值至少大于0.1A,吸光值最好在0.1-1.5A。在此范围内,颗粒的干扰相对较小,结果稳定。从而意味着样品的浓度不能过低,或者过高(超过光度计的测试范围)。最后是操作因素,如混合要充分,否则吸光值太低,甚至出现负值;混合液不能存在气泡,空白液无悬浮物,否则读数漂移剧烈;必须使用相同的比色杯测试空白液和样品,否则浓度差异太大;换算系数和样品浓度单位选择一致;不能采用窗口磨损的比色杯;样品的体积必须达到比色杯要求的最小体积等多个操作事项。


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其他

除了核酸浓度,分光光度计同时显示几个非常重要的比值表示样品的纯度,如A260/A280的比值,用于评估样品的纯度,因为蛋白的吸收峰是280nm。纯净的样品,比值大于1.8(DNA)或者2.0(RNA)。如果比值低于1.8 或者2.0,表示存在蛋白质或者酚类物质的影响。A230表示样品中存在一些污染物,如碳水化合物,多肽,苯酚等,较纯净的核酸A260/A230的比值大于2.0。A320检测溶液的混浊度和其他干扰因子。纯样品,A320一般是0。

本实验来源于牡丹江医学院《检验专业实验指导》。


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